More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3233 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  100 
 
 		 433 aa  820    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  64.5 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  57.28 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  59.38 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  62.38 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  55.58 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  53.57 
 
 		 409 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  48.94 
 
 		 415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  51.17 
 
 		 407 aa  335  7e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  53.3 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  51.54 
 
 		 412 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  51.97 
 
 		 449 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  52.14 
 
 		 413 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  45.24 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  43.68 
 
 		 487 aa  302  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  46.38 
 
 		 465 aa  295  9e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  47.41 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  40.56 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  46.32 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  47.6 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  44.84 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  41.71 
 
 		 390 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  43.24 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  42.65 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  43.31 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  49.2 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  42.09 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  42.45 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  42.81 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  36.57 
 
 		 461 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  47.01 
 
 		 377 aa  186  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.47 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  41.03 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  38.27 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  42.6 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  31.88 
 
 		 460 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  39.3 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  39.3 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  38.15 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  40.69 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  40.69 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  39.02 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  38.01 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.62 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  40.16 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  45.95 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.89 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.89 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.89 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  43.19 
 
 		 484 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.88 
 
 		 483 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  34.39 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  36.12 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  37.55 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.29 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  34.44 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  43.43 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  30.21 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  36.04 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.77 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.5 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.77 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.77 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  31.72 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  33.04 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.5 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  43.06 
 
 		 376 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.5 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.24 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  36.16 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  36.16 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  34.88 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.24 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.64 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.56 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.28 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  45.83 
 
 		 503 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.3 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.3 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  43.06 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  34.23 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.89 
 
 		 485 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  42.08 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  42.08 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  41.7 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.54 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  36.28 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  39.11 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.97 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  41.67 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  30.6 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  30.6 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  27.84 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  31.24 
 
 		 467 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.35 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  37.81 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  43.19 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  32.38 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  37.85 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  37.85 
 
 		 391 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>