More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2382 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  100 
 
 		 407 aa  800    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  47.62 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  50.48 
 
 		 484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  44.41 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  41.71 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  38.72 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  44.41 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  45.21 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  38.32 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  39.53 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  39.53 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  43.44 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  40.05 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  38.85 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  39.27 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  38.85 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  44.9 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  39.01 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  44.35 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  44.35 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  39.27 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  38.58 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  39.11 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  39.16 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  44.74 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  44.35 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  42.3 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  42.3 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  38.76 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  40.76 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  41.14 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  45.31 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  38.32 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  44.75 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  41.42 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  44.51 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  41.69 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  48.79 
 
 		 503 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  35.24 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  35.24 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  35.24 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  36.98 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  35.06 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  36.98 
 
 		 391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  35.06 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  39.04 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  34.48 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  37.39 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  37.39 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  37.39 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  37.39 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  37.39 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  38.97 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  37.08 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  37.27 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  40.21 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  33.58 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  45.76 
 
 		 415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  46 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  47.01 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  41.98 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  37.7 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  38.98 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  47.74 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  45.12 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  42.86 
 
 		 482 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  42.63 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  39.78 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.88 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  38.85 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  41.5 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  39.84 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  34.17 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  37.11 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  39.84 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  35.59 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  38.7 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  38.49 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.73 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  38.85 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  39.16 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  35.69 
 
 		 482 aa  143  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  40.64 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  37 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  34.31 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.55 
 
 		 476 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.55 
 
 		 476 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  32.71 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  32.71 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  31.31 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  42.91 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  37.86 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  41.6 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.55 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  40 
 
 		 445 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  35.48 
 
 		 498 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  36.92 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  37.4 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.18 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.18 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>