More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0560 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  92.46 
 
 		 398 aa  757    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  100 
 
 		 398 aa  822    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  52.53 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  52.53 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  50.53 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  46.56 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  46.56 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  46.56 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  46.56 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  46.56 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  46.56 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  46.56 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  46.56 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  46.56 
 
 		 391 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  48.39 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  48.39 
 
 		 391 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  48.39 
 
 		 391 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  48.68 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  48.68 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  46.06 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  46.82 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  49.33 
 
 		 395 aa  338  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  45.02 
 
 		 391 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  43.41 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  40.67 
 
 		 403 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  41.51 
 
 		 399 aa  295  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  42.74 
 
 		 395 aa  295  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  41.51 
 
 		 399 aa  295  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  41.3 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  41.3 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  40.99 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  40.47 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  40.47 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  39.95 
 
 		 399 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  40.73 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  41.14 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  39.11 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  43.2 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  44.94 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  40.98 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  36.91 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  45.06 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  37.86 
 
 		 484 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  40.86 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  41.37 
 
 		 376 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  39.76 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  40.62 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  41.21 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  39.07 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  39.07 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  38.64 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  38.76 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  43.69 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  38.12 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  40.35 
 
 		 365 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  39.94 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  37.77 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  37.13 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  41.58 
 
 		 449 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  41.22 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  40.29 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  42.12 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  40.53 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  41.51 
 
 		 407 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  40.46 
 
 		 409 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  41.76 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  37.36 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.3 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.05 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.14 
 
 		 464 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.14 
 
 		 464 aa  176  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  39.26 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  41 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.8 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.8 
 
 		 464 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.8 
 
 		 464 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  34.8 
 
 		 464 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.8 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.8 
 
 		 464 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.44 
 
 		 464 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  36.88 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.13 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  37.13 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  37.69 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  36.79 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  40.53 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  36.23 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.86 
 
 		 476 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  36.16 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  36.69 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  38.46 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.17 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  37.16 
 
 		 554 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  36.07 
 
 		 467 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  36.36 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  37.64 
 
 		 498 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.93 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.93 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  37.22 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.93 
 
 		 477 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>