More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2422 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  100 
 
 		 468 aa  975    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  56.62 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  57.42 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  55.67 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  54.11 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  51.91 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  55.35 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  36.28 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  35.75 
 
 		 473 aa  259  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  35.84 
 
 		 414 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  33.04 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  33.17 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.37 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.49 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  32.85 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.28 
 
 		 486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.81 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.81 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  31.38 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  32.54 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  32.37 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.57 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  31.73 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.36 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.57 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.87 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  31.89 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  31.4 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.69 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  29.85 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  32.52 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.7 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  30 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  31.72 
 
 		 471 aa  190  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  31.84 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  30 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  31.49 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  29.06 
 
 		 461 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.73 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.06 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  30.61 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.54 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.54 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  30.54 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.94 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.94 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.94 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.49 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.3 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.12 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  32.38 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.38 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  30.61 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  32.14 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  32.38 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.9 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  31.9 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  31.9 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  31.9 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.9 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  26.86 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.5 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.5 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  26.86 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.31 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.31 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.42 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.27 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  31.36 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.09 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.16 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.09 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.09 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  30.7 
 
 		 440 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  28.87 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  29.47 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.55 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  29.91 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  30.84 
 
 		 554 aa  156  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  28.33 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  29.45 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.96 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.96 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  28.27 
 
 		 427 aa  153  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  34.2 
 
 		 498 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  32.09 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  32.09 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  36.96 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  28.33 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  31.94 
 
 		 466 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  32.32 
 
 		 466 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  33.43 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  36.36 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  29.27 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  28.88 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.4 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.4 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.55 
 
 		 476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.03 
 
 		 476 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.14 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>