More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1383 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  100 
 
 		 431 aa  887    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  100 
 
 		 431 aa  887    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  100 
 
 		 431 aa  887    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  99.3 
 
 		 431 aa  880    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  100 
 
 		 431 aa  887    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  78.42 
 
 		 431 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  97.91 
 
 		 431 aa  853    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  98.84 
 
 		 431 aa  879    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  78.65 
 
 		 431 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  78.65 
 
 		 431 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  78.65 
 
 		 431 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  78.65 
 
 		 431 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  887    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  99.07 
 
 		 431 aa  879    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  65.2 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.12 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  53.94 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.12 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  54.02 
 
 		 440 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  51.89 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  54.14 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  52.41 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  54.4 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.28 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.14 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  39.85 
 
 		 427 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  37.75 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.76 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  35.01 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  35.38 
 
 		 452 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  36.67 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  35.82 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  35.03 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  34.95 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  35.49 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  35.73 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  35.03 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  35.44 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  35.03 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  35.03 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  34.44 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  34.19 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  34.74 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.7 
 
 		 475 aa  202  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  33.74 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  30.8 
 
 		 471 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.18 
 
 		 482 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  30.73 
 
 		 466 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  31.81 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  31.9 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  37.55 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  31.5 
 
 		 471 aa  162  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  38.28 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  31.09 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  38.28 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  28.47 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  30.88 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  29.17 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  35.71 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  37.98 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  35.63 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  33.67 
 
 		 554 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  36.9 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  34.05 
 
 		 469 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.02 
 
 		 477 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.74 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.07 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.07 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.29 
 
 		 481 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.43 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.51 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  35.71 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  34.26 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  36.36 
 
 		 471 aa  139  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  36.86 
 
 		 506 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.07 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.07 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.07 
 
 		 484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  32.85 
 
 		 391 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  32.85 
 
 		 391 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  32.85 
 
 		 391 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  32.85 
 
 		 391 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  32.85 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  34.23 
 
 		 483 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  31.8 
 
 		 452 aa  135  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  37.91 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  34.47 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  32.71 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  34.47 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  32.71 
 
 		 391 aa  134  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.47 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  30.2 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  31.52 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  31.52 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  33.83 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  33.46 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  31.7 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  31.52 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  31.52 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  31.52 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>