More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1545 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  100 
 
 		 466 aa  946    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  95.49 
 
 		 466 aa  909    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  51.42 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  48.92 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  48.91 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  48.71 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02061  isochorismate synthase  34.66 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0179  isochorismate synthase  34.72 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01971  isochorismate synthase  33.86 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01951  isochorismate synthase  33.86 
 
 		 470 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  31.96 
 
 		 498 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  30.6 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  32.61 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  32.01 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  32.15 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  32.5 
 
 		 492 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  32.5 
 
 		 492 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  31.34 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.48 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  34.23 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  29.52 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  36.26 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  31.28 
 
 		 451 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.98 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  32.2 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.71 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  29.23 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  29.86 
 
 		 469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  29.33 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  35.29 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  35.29 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  30.18 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  34.33 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  30.65 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.97 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  31.46 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  37.31 
 
 		 466 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.2 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  33.94 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.41 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.19 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.41 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.23 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.2 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.74 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.23 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  36.57 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.07 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  35.36 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  31.94 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  28.6 
 
 		 486 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  29.14 
 
 		 473 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.09 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  36.05 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.32 
 
 		 481 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  31.84 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  36.29 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  35.51 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  31.91 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  31.95 
 
 		 398 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.12 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.47 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.68 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.61 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.12 
 
 		 492 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  32.09 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  34.33 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  34.78 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  33.97 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  31.29 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  31.29 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.69 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.69 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  31.75 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  27.63 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  31.55 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  29.37 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  29.21 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.32 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  29.07 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  35.71 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  32.06 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  33.45 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  32.28 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  35.29 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  32.17 
 
 		 399 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  34.32 
 
 		 425 aa  133  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  31.44 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  34.41 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  33.46 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  33.46 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  32.59 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  35.8 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>