More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0751 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  100 
 
 
384 aa  790    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  36.33 
 
 
460 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  41.9 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.79 
 
 
477 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.04 
 
 
481 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  40.96 
 
 
486 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  39.29 
 
 
461 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.08 
 
 
476 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.08 
 
 
476 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  40.98 
 
 
485 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  32.89 
 
 
464 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.7 
 
 
464 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.15 
 
 
464 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.15 
 
 
464 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.15 
 
 
464 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.15 
 
 
464 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.15 
 
 
464 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.15 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.15 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.05 
 
 
484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.64 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.06 
 
 
464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.05 
 
 
484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  38.7 
 
 
453 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  38.7 
 
 
453 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.87 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.05 
 
 
492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  39.78 
 
 
455 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.49 
 
 
476 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.48 
 
 
451 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  38.4 
 
 
451 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  37.08 
 
 
456 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  36.9 
 
 
482 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  44.95 
 
 
498 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 
476 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  34.69 
 
 
467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.59 
 
 
440 aa  172  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  30.68 
 
 
415 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  36.74 
 
 
445 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  37.01 
 
 
451 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  34.96 
 
 
452 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  36.4 
 
 
409 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  37.23 
 
 
492 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  37.23 
 
 
492 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.74 
 
 
435 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.29 
 
 
554 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  32.27 
 
 
435 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  44.74 
 
 
471 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  29.82 
 
 
412 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.26 
 
 
435 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  39.18 
 
 
473 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  44.21 
 
 
471 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  37.64 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  37.26 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  35.02 
 
 
407 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  35.69 
 
 
495 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  41.41 
 
 
506 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  39.9 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  34.09 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  34.1 
 
 
386 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  35.09 
 
 
452 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  35.92 
 
 
452 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  33.44 
 
 
414 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  32.88 
 
 
452 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  34.55 
 
 
259 aa  143  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  33.46 
 
 
473 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  35.91 
 
 
466 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  36.29 
 
 
466 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.71 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  35.54 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  35.66 
 
 
466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  33.88 
 
 
391 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  31.73 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  33.71 
 
 
452 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.25 
 
 
455 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  33.71 
 
 
452 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  29.25 
 
 
455 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  34.98 
 
 
460 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  36.36 
 
 
398 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  31.95 
 
 
465 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.93 
 
 
452 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  32.95 
 
 
452 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  32.95 
 
 
452 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.25 
 
 
455 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  33.71 
 
 
452 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  32.84 
 
 
482 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  33.33 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  36.82 
 
 
473 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  32.97 
 
 
452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  31.92 
 
 
483 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.73 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  30.27 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  28.34 
 
 
432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  28.29 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  35.82 
 
 
475 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  34.38 
 
 
397 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  33.33 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  31.97 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  33.47 
 
 
441 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>