More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1833 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  88.22 
 
 
484 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.78 
 
 
481 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  100 
 
 
481 aa  940    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.84 
 
 
476 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.84 
 
 
476 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  75.27 
 
 
477 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  88.02 
 
 
492 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  87.81 
 
 
484 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  50.87 
 
 
476 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  50.65 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  39.91 
 
 
469 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.43 
 
 
460 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  37.22 
 
 
467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.44 
 
 
461 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33 
 
 
464 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  40.52 
 
 
482 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  39.23 
 
 
451 aa  223  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  36.65 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.42 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  35.39 
 
 
464 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.9 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.9 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  41.35 
 
 
485 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.07 
 
 
464 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.9 
 
 
464 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.9 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.07 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.9 
 
 
464 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.9 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  37.53 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  38.35 
 
 
486 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.7 
 
 
483 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  40.8 
 
 
445 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  46.62 
 
 
409 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  46.3 
 
 
415 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  46.07 
 
 
412 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  39.49 
 
 
451 aa  196  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  37.35 
 
 
449 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  36.81 
 
 
554 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  32.44 
 
 
492 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  32.44 
 
 
492 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  29.45 
 
 
453 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  29.45 
 
 
453 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  43.07 
 
 
407 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  32.11 
 
 
471 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  37.89 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  35.83 
 
 
384 aa  190  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  36.75 
 
 
465 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.42 
 
 
440 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  36.83 
 
 
495 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  33.04 
 
 
498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.1 
 
 
471 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  35.78 
 
 
428 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  29.06 
 
 
456 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  45.8 
 
 
424 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  32.1 
 
 
506 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  41.5 
 
 
473 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.69 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  41.41 
 
 
451 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  35.29 
 
 
435 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  36 
 
 
447 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.84 
 
 
482 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  33.06 
 
 
473 aa  171  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  32.96 
 
 
452 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  38.74 
 
 
402 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  33.33 
 
 
469 aa  169  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  39.84 
 
 
395 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  37.57 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  32.78 
 
 
452 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  40.15 
 
 
425 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  40.15 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  32.41 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.75 
 
 
452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  34.15 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  34.25 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  37.12 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  37.69 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  40.59 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  42.62 
 
 
259 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  31.87 
 
 
391 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  35.77 
 
 
391 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  37.4 
 
 
398 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  31.39 
 
 
468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  32.03 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  47.95 
 
 
467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  31.54 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  36.78 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  37.05 
 
 
490 aa  163  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  35.79 
 
 
398 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  37.31 
 
 
391 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.75 
 
 
452 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  31.28 
 
 
391 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.75 
 
 
452 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  31.28 
 
 
391 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  32.32 
 
 
473 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  40.51 
 
 
425 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  31.28 
 
 
391 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  37.31 
 
 
391 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  38.15 
 
 
386 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  31.28 
 
 
391 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>