More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0516 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  100 
 
 		 428 aa  840    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  61.74 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  57.6 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  59.14 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  51.98 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  52.85 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  53.83 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  59.11 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  51.56 
 
 		 449 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  52.81 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  51.86 
 
 		 412 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  52.07 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  47.94 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  47.22 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  46.36 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  41.72 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  41.09 
 
 		 435 aa  252  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  49.64 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.01 
 
 		 464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.43 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  37.32 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.17 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.62 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  32.83 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.08 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.08 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.08 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.08 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.08 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.33 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.08 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  45.29 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.08 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  41.48 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  45.53 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  34.4 
 
 		 467 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  41.54 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  35.48 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.52 
 
 		 554 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  35.84 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  42.47 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  37.47 
 
 		 445 aa  182  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  42.8 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  42.38 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  36.79 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  41.64 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  42.38 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  41.64 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  41.26 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  34.4 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  41.64 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.81 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  41.64 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.4 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  41.64 
 
 		 399 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  41.64 
 
 		 399 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  41.64 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  34.39 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.7 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  39.77 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.7 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.7 
 
 		 492 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.28 
 
 		 481 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.01 
 
 		 477 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  37.55 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  41.35 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  40.07 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  43.06 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  41.26 
 
 		 390 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  36.88 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.4 
 
 		 476 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.4 
 
 		 476 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.42 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  36.74 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  39.52 
 
 		 484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  35.69 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.41 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  38.8 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  28.7 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  38.19 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  34.69 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  37.88 
 
 		 469 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  36.08 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  36.08 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  31.53 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  37.28 
 
 		 391 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  34.48 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.42 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  38.82 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  39.68 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  33.33 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.42 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  38.04 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  36.92 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  36.92 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  36.92 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  36.92 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  36.92 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  36.92 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>