More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1481 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  99.12 
 
 		 455 aa  931    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  99.34 
 
 		 455 aa  932    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  100 
 
 		 455 aa  936    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  59.18 
 
 		 432 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  55.23 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  55.03 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  55.23 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  55.8 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.12 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  52.12 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  52.12 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.34 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  52.12 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  52.12 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  52.34 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  52.12 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  52.12 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  49.78 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  49.78 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  49.78 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  49.78 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  49.89 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  47.15 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  43.88 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  44.25 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  42.93 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  42.3 
 
 		 435 aa  308  9e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  37.29 
 
 		 427 aa  259  7e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  37.01 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  36.79 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  36.79 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  37.03 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  37.18 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  36.56 
 
 		 452 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  36.38 
 
 		 452 aa  239  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  36.15 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  36.21 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  36.38 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  37.47 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  35.61 
 
 		 452 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  35.17 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  35.52 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  33.9 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  37.73 
 
 		 432 aa  196  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  30.8 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  33.65 
 
 		 482 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  30.54 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  29.7 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  31.76 
 
 		 466 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30.75 
 
 		 473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  31.97 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  30.77 
 
 		 473 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  31.81 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.78 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  35.74 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.78 
 
 		 492 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  32.92 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.54 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  28.83 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  38.84 
 
 		 259 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  34.87 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.96 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  35.19 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.25 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.58 
 
 		 492 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  38.06 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.58 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  29.25 
 
 		 384 aa  139  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  34.01 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.15 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  32.02 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  30.21 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2823  isochorismate synthase  30.17 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.27 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.86 
 
 		 471 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  29.61 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  31.75 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  29.41 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.5 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  31.45 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  29.41 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  35.71 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  30.03 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  36.02 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  30.98 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.12 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.12 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.12 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.56 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  29.25 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  33.1 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31.58 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  31.17 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  35.71 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  30.12 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  30.12 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  34.85 
 
 		 505 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.86 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  32.04 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  32.93 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>