More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0130 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  70.13 
 
 		 452 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  67.48 
 
 		 452 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  69.69 
 
 		 452 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  69.69 
 
 		 452 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  68.41 
 
 		 460 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  70.13 
 
 		 452 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  100 
 
 		 452 aa  930    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  70.35 
 
 		 452 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  66.37 
 
 		 452 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  67.7 
 
 		 452 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  67.7 
 
 		 452 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  67.04 
 
 		 452 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  67.48 
 
 		 452 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  67.26 
 
 		 452 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  70.53 
 
 		 414 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  38.75 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.04 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  38.02 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  40.05 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.1 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  34.88 
 
 		 475 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  36.74 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.02 
 
 		 431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.02 
 
 		 431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.02 
 
 		 431 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.02 
 
 		 431 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.02 
 
 		 431 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.47 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  37.8 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.23 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  36.99 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  33.92 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  34.75 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.67 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  35.67 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.44 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  35.44 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.44 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  35.44 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  35.44 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  35.44 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  38.3 
 
 		 442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  35.21 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  38.69 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  36.76 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  35.36 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  33.49 
 
 		 468 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  35.03 
 
 		 473 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  31.9 
 
 		 473 aa  206  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  33.66 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  31.45 
 
 		 477 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30.98 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.73 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  33.58 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  32.28 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  30.39 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.9 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  36.16 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  32.93 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  28.67 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.35 
 
 		 482 aa  182  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  34.64 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  31 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  41.03 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  30.84 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.88 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.59 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.59 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.59 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  34.65 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  30.86 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.8 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  38.49 
 
 		 259 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  33.62 
 
 		 554 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  31.04 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.98 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.98 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.98 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.08 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.01 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.01 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.15 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  30.73 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  31.92 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  36.48 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  41.86 
 
 		 473 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  37.45 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  27.47 
 
 		 492 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  27.47 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.27 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  35.53 
 
 		 377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.94 
 
 		 464 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.78 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  31.09 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.08 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.49 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.49 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  40.65 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  35.09 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>