More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1774 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  100 
 
 		 359 aa  748    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4718  isochorismate synthase  44.35 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09908  possible isochorismate synthase  38.95 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0924812  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1525  isochorismate synthase, putative  36.13 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0770  Chorismate binding-like protein  30.98 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1758  isochorismate synthase  31.88 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0818016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  29.97 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5138  Chorismate binding-like protein  34.34 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  33.87 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  31.27 
 
 		 466 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  31.94 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  34.2 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  28.45 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  30.98 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  33.58 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  31.68 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  30.62 
 
 		 485 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  31.52 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  32.16 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.14 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.2 
 
 		 475 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  32.82 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  29.92 
 
 		 449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  31.92 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  31.05 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  30.08 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  31.98 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  31.75 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  30.22 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  33.85 
 
 		 506 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  29.5 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  28.46 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  32.69 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  31.1 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  29.11 
 
 		 409 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  32 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  30.42 
 
 		 452 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.14 
 
 		 452 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  29.93 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.17 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  28.25 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  29.11 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.07 
 
 		 464 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.11 
 
 		 431 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.35 
 
 		 492 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.11 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.11 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.11 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  30.26 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.11 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  30.68 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.97 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  29.23 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  29.11 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  30.3 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  28.87 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  25.85 
 
 		 451 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  29.96 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  31.25 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.23 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.95 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  28.16 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  30.92 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  28.16 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  26.92 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.95 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  30.2 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.2 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  28.96 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  28.96 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  30.42 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  30.3 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  29.75 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  29 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.42 
 
 		 431 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  31.42 
 
 		 431 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.01 
 
 		 464 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.01 
 
 		 464 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.01 
 
 		 464 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.42 
 
 		 431 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  28.96 
 
 		 391 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  31.42 
 
 		 431 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  31.42 
 
 		 431 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  28.96 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  28.96 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  28.96 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  28.96 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  28.96 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  30.3 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.42 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  31.42 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.57 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.08 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  33.6 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  29.92 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.01 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.54 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.74 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  30.61 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>