More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09908 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09908  possible isochorismate synthase  100 
 
 		 366 aa  749    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0924812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4718  isochorismate synthase  43.45 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  38.95 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1525  isochorismate synthase, putative  32.9 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0770  Chorismate binding-like protein  34.01 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5138  Chorismate binding-like protein  35.64 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1758  isochorismate synthase  34.56 
 
 		 405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0818016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  27.54 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  31.32 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  33.22 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  32.62 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  32.73 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  32.62 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  32.73 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  32.01 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  32.01 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  32.26 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  29.88 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  30.4 
 
 		 455 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  29.41 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  31.11 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  31.71 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  27.3 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  29.01 
 
 		 485 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  31.14 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  29.04 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  32.73 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  29.93 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  29.89 
 
 		 466 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  29.52 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  31.82 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  28.93 
 
 		 451 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  29.62 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  29.3 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  31.62 
 
 		 483 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  28.31 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  27.15 
 
 		 554 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  30.15 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  30.04 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  32.72 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  30.04 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  30.58 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  28.78 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  32.69 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  29.67 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  29.67 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  29.67 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  29.67 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  29.67 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  27.91 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  27.91 
 
 		 391 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  29.67 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  29.67 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.59 
 
 		 481 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  27.91 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  27.91 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  27.61 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  28.68 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.41 
 
 		 475 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  32.01 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  29.76 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  27.15 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  29.76 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  28.72 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.73 
 
 		 484 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 409 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  29.35 
 
 		 452 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  28 
 
 		 449 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  30.86 
 
 		 471 aa  102  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  27.59 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  29.05 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.73 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  28.83 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  27.8 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  27.84 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  27.59 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.36 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  27.68 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.86 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.86 
 
 		 464 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  27.68 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  28.32 
 
 		 425 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  28.32 
 
 		 465 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  26.99 
 
 		 495 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.43 
 
 		 435 aa  99.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  29.39 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  28.87 
 
 		 441 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  27.84 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  28.83 
 
 		 498 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  26.33 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  28 
 
 		 452 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.52 
 
 		 476 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  29.21 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  28.73 
 
 		 447 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  29.06 
 
 		 424 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.42 
 
 		 471 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  27.34 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  28.1 
 
 		 464 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>