More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1758 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1758  isochorismate synthase  100 
 
 		 405 aa  844    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0818016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0770  Chorismate binding-like protein  37.96 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5138  Chorismate binding-like protein  35.58 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4718  isochorismate synthase  38.35 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  31.88 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1525  isochorismate synthase, putative  32.65 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376794 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09908  possible isochorismate synthase  34.56 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0924812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  32.7 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  33.69 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  32.7 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  32.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  32.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  32.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  32.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  32.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  32.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  30.95 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  32.48 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  32.48 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  30.86 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  30.51 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  30.51 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  31.37 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  30.51 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  30.51 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  31.53 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  31 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  31 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  29.2 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  31 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  30.15 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  30.18 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  30.88 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  29.18 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  30.58 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  29.85 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  31.29 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  31.16 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  30.4 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  31.43 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  27.94 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  30.82 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  31.64 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  30.82 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  30.66 
 
 		 465 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  31.07 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.39 
 
 		 451 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  30.8 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.89 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  31.48 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.97 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  28.33 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  28.01 
 
 		 467 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  26.97 
 
 		 475 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02061  isochorismate synthase  29.01 
 
 		 465 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.21 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.2 
 
 		 464 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.37 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.37 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.37 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.37 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  27.24 
 
 		 505 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.37 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.42 
 
 		 464 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.42 
 
 		 464 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  28.48 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.52 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.52 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  29.09 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  29.73 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.52 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.52 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.52 
 
 		 464 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  29.43 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  31.62 
 
 		 471 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  29.73 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  29.86 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  29.51 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.52 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  28.24 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  30.37 
 
 		 432 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  25.14 
 
 		 460 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  28.85 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  29.77 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  30.32 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  29.19 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  28.62 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  29.37 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0179  isochorismate synthase  29.54 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  30.12 
 
 		 259 aa  91.3  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 484 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  28.52 
 
 		 506 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  29.27 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  29.74 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  30.18 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  29.74 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.84 
 
 		 481 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.78 
 
 		 492 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  28.2 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>