More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4718 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4718  isochorismate synthase  100 
 
 
356 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09908  possible isochorismate synthase  43.45 
 
 
366 aa  279  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0924812  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  44.35 
 
 
359 aa  272  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1525  isochorismate synthase, putative  34.07 
 
 
368 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0770  Chorismate binding-like protein  36.88 
 
 
438 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324885  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1758  isochorismate synthase  38.35 
 
 
405 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0818016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5138  Chorismate binding-like protein  36.1 
 
 
415 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  31.68 
 
 
413 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  33.98 
 
 
469 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  31.46 
 
 
485 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  30.57 
 
 
398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  31.53 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  31.6 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  33.33 
 
 
486 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.27 
 
 
484 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.27 
 
 
484 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  32.33 
 
 
467 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.27 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  29.69 
 
 
451 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  29.84 
 
 
445 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.66 
 
 
451 aa  126  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  29.04 
 
 
425 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.93 
 
 
481 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  29.85 
 
 
431 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  31.37 
 
 
455 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.45 
 
 
498 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  30.45 
 
 
395 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  26.96 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.86 
 
 
440 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.48 
 
 
476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  32.94 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  31.58 
 
 
483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  31.65 
 
 
432 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  27.48 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  27.48 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  28.22 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  31.6 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.85 
 
 
435 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.12 
 
 
481 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  31.25 
 
 
435 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  30.6 
 
 
384 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  30.86 
 
 
466 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  27.16 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  27.16 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  27.16 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  26.19 
 
 
476 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  30.3 
 
 
442 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  26.19 
 
 
476 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  27.16 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  29.64 
 
 
554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  29.92 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.22 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  27.16 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  30.56 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  27.16 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.22 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  28.84 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  30.17 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.77 
 
 
477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.22 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.22 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.22 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  30.04 
 
 
395 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  30.11 
 
 
482 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  30.63 
 
 
399 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  26.84 
 
 
391 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  29.67 
 
 
402 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  30.4 
 
 
393 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  28.84 
 
 
495 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  29.52 
 
 
440 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  29.74 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  32.31 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  32.31 
 
 
492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  29.81 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  29.87 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  30.37 
 
 
441 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  29.8 
 
 
471 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  30.64 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  30.63 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  30.63 
 
 
399 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  30.63 
 
 
399 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  30.63 
 
 
399 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  26.67 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  26.67 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  27.57 
 
 
461 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  26.67 
 
 
391 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  26.67 
 
 
391 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  30.26 
 
 
399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  28.36 
 
 
428 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.16 
 
 
471 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  26.67 
 
 
391 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  29.6 
 
 
403 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  30.26 
 
 
399 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  27.41 
 
 
377 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  28.67 
 
 
447 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  29.43 
 
 
415 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  27.04 
 
 
487 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  29.2 
 
 
394 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  29.7 
 
 
409 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  29.37 
 
 
465 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>