232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0160 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0160  DNA polymerase domain-containing protein  100 
 
 		 425 aa  858    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0188  DNA polymerase III beta subunit family protein  53.74 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_248  DNA polymerase III domain protein  53.27 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.864877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.32 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.4 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  25.42 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.71 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  26.91 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  29.34 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28.23 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  20.9 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.71 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  26.91 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.58 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  25.7 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  27.47 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.2 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  22.92 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.4 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.79 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.87 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.4 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.61 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000559768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.86 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.21 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.16 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000000103313  normal  1 
 
 
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  25.24 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  25.24 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.81 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.79 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.39 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  26.22 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.15 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  25.88 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  24.32 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.51 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  22.73 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.35 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.06 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.17 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.79 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.71 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.09 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  23.3 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.67 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.68 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.68 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0535  DNA polymerase III, beta subunit  25.13 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.79 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  26.27 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.16 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.04 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.41 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.45 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.31 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.8 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4145  DNA polymerase III, beta subunit  25.31 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.258487 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0937  DNA polymerase III, beta subunit  20.33 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  25.58 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.27 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.1 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.74 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.55 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.83 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0002  DNA polymerase III, beta chain  22.98 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  23.21 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.38 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00413752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.86 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104576  unclonable  0.00000179673 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  24.18 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0036  DNA polymerase III, beta subunit  24.16 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.16 
 
 		 367 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40244  normal  0.672581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  24.74 
 
 		 378 aa  57  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.97 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0002  DNA polymerase III subunit beta  20 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  22.76 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.29 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.76 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  22.76 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.1 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  22.98 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  22.98 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.71 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.7 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.76 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.05 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  26 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.36 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  22.76 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0002  DNA polymerase III, beta chain  22.18 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.5 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000467404  unclonable  0.000000000568152 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.76 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.1 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.64 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.96 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0002  DNA polymerase III subunit beta  20 
 
 		 355 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.1 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  22.95 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>