More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0937 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0937  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 375 aa  760    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  30.19 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.5 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.5 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.5 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.48 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  32.1 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.61 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  26.18 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.24 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.73 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  26.73 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.22 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.3 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.88 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3183  DNA polymerase III subunit beta  24.8 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00267181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.8 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.011531  normal  0.38726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.8 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0645593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3441  DNA polymerase III subunit beta  25.6 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.325472  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.54 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00413752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0002  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2236  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0300  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0088  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2849  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.645907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3240  DNA polymerase III subunit beta  25.61 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.52 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232451  hitchhiker  0.0000583688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.52 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481367  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2554  DNA polymerase III subunit beta  24.52 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376427  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.52 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0846842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.19 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  27.13 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.95 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  25.54 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  25.54 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  25.54 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  25.54 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  27.73 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.73 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.07 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.73 
 
 		 367 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.33 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4049  DNA polymerase III subunit beta  25.54 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.33 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0290452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.4 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.59 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4461  DNA polymerase III subunit beta  24.59 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591962  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  26.67 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  26.94 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.41 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201514  hitchhiker  0.00206466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.78 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03584  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000276402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  26.94 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4066  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0145467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4224  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000133889  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03528  hypothetical protein  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0647653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3914  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000199842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4211  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5129  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000402669  normal  0.135624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.37 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0002  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  28.03 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  23.66 
 
 		 366 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  24.13 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  24.28 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0033  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234864  normal  0.233091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.7 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.87 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.51 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.6 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  24.13 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4145  DNA polymerase III, beta subunit  27.2 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.258487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.97 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  25.65 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.72 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.51 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.2 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.21 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0132  DNA polymerase III, beta subunit  26.6 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.16 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  27.13 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.01 
 
 		 366 aa  135  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.4 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000101704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.88 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.453135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.41 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000008266  decreased coverage  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.32 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.23 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>