More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2805 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  987    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
486 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  58.71 
 
 
491 aa  578  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 
485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.18 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.01 
 
 
487 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
486 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
487 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
490 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
492 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.56 
 
 
486 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
492 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.54 
 
 
492 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.92 
 
 
489 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.8 
 
 
486 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
492 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  59.13 
 
 
492 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.35 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
487 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.51 
 
 
486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 
492 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 
486 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
495 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
492 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
492 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
487 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
492 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.79 
 
 
487 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.5 
 
 
488 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.5 
 
 
488 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.42 
 
 
485 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.58 
 
 
487 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.09 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
487 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.58 
 
 
487 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.01 
 
 
485 aa  538  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
487 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
492 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
488 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
495 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
488 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
489 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.07 
 
 
487 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.28 
 
 
489 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  55.42 
 
 
490 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 
498 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
485 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.47 
 
 
500 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.52 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.26 
 
 
505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.26 
 
 
505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.69 
 
 
487 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
487 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
487 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
487 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
487 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
487 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.28 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
490 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
495 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.18 
 
 
495 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.08 
 
 
484 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.96 
 
 
405 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.63 
 
 
481 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.25 
 
 
471 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
466 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.16 
 
 
484 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.47 
 
 
493 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2936  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4556  Aldehyde Dehydrogenase  38.69 
 
 
1577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0270353  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.05 
 
 
491 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.68 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.71 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.71 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.26 
 
 
480 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
496 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  32.98 
 
 
493 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.26 
 
 
480 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.26 
 
 
480 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.47 
 
 
485 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.85 
 
 
485 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.98 
 
 
493 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  34.04 
 
 
493 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
490 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>