More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2936 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2936  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  972    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.49 
 
 
485 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5600  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.01 
 
 
484 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5024  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.03 
 
 
485 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4416  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.56 
 
 
485 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1587  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.58 
 
 
489 aa  614  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4998  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.84 
 
 
489 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4969  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.69 
 
 
482 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506966  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3732  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.7 
 
 
485 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  60.29 
 
 
489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 
489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  60.59 
 
 
482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 
489 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 
493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.83 
 
 
493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  60.97 
 
 
480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.03 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.42 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58 
 
 
482 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58 
 
 
482 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.8 
 
 
482 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  57.8 
 
 
482 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.59 
 
 
482 aa  567  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0257  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.37 
 
 
485 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 
493 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.8 
 
 
482 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.8 
 
 
482 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  57.8 
 
 
482 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
486 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
492 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.97 
 
 
486 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.83 
 
 
480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.83 
 
 
480 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.71 
 
 
484 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.5 
 
 
480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.83 
 
 
480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.04 
 
 
492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.21 
 
 
484 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.79 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.39 
 
 
483 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.83 
 
 
480 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0149  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
485 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 
500 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.13 
 
 
509 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
482 aa  559  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.73 
 
 
483 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
482 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.55 
 
 
490 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.82 
 
 
484 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.56 
 
 
483 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
482 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.34 
 
 
496 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
482 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
486 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.16 
 
 
482 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.11 
 
 
483 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  58.06 
 
 
491 aa  555  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.11 
 
 
480 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.11 
 
 
480 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.73 
 
 
482 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.73 
 
 
482 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.01 
 
 
486 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.91 
 
 
488 aa  555  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.73 
 
 
482 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.66 
 
 
479 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.8 
 
 
486 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.66 
 
 
479 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
489 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.52 
 
 
482 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
484 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
491 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
488 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.69 
 
 
484 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.13 
 
 
485 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
486 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.58 
 
 
500 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.53 
 
 
483 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  59.66 
 
 
482 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
500 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
486 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.32 
 
 
490 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.96 
 
 
482 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  59.05 
 
 
497 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.11 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.02 
 
 
493 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
485 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.32 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.93 
 
 
485 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>