More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0529 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
466 aa  931    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.99 
 
 
484 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.54 
 
 
492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.54 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.43 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  51.1 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  465  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.33 
 
 
489 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.42 
 
 
482 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.42 
 
 
486 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.32 
 
 
492 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
492 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.21 
 
 
487 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.43 
 
 
489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.48 
 
 
492 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
486 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.77 
 
 
486 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
486 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.98 
 
 
486 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
491 aa  448  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.33 
 
 
495 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.77 
 
 
486 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.63 
 
 
486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.33 
 
 
486 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.23 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.98 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.72 
 
 
488 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.77 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.86 
 
 
487 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.02 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
487 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.18 
 
 
488 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
488 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
487 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.53 
 
 
488 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 
490 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
485 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.18 
 
 
487 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.42 
 
 
487 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
487 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.98 
 
 
487 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.42 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.66 
 
 
488 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
489 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.42 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
487 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  44.56 
 
 
495 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
471 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.2 
 
 
487 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  48.93 
 
 
490 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.42 
 
 
487 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.42 
 
 
487 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
495 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.66 
 
 
487 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.42 
 
 
487 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
487 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.42 
 
 
487 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
487 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.55 
 
 
487 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.55 
 
 
487 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.42 
 
 
487 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
500 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.67 
 
 
495 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
487 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.67 
 
 
498 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.58 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.45 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.67 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.87 
 
 
405 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  36.78 
 
 
516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4556  Aldehyde Dehydrogenase  34.99 
 
 
1577 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0270353  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  34.03 
 
 
457 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  32.86 
 
 
477 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  32.16 
 
 
500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  32.79 
 
 
499 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  34.33 
 
 
503 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  32.62 
 
 
477 aa  194  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  32.3 
 
 
477 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
490 aa  193  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 
481 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  33.75 
 
 
485 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  34.1 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  33.89 
 
 
498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  34.62 
 
 
455 aa  190  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  30.4 
 
 
486 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  34.71 
 
 
483 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  31.03 
 
 
486 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>