More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4556 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4556  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
1577 aa  3165    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0270353  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
488 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
488 aa  255  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
487 aa  242  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.52 
 
 
487 aa  241  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
487 aa  238  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.1 
 
 
486 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
487 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  34.09 
 
 
490 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.42 
 
 
486 aa  236  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
481 aa  236  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.46 
 
 
492 aa  235  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
489 aa  234  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  38.33 
 
 
487 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.75 
 
 
487 aa  234  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.26 
 
 
487 aa  234  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.16 
 
 
486 aa  234  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.75 
 
 
487 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
487 aa  232  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
487 aa  232  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.11 
 
 
487 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.11 
 
 
487 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
487 aa  231  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
486 aa  231  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.32 
 
 
487 aa  231  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
486 aa  231  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.98 
 
 
489 aa  230  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.79 
 
 
488 aa  229  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
488 aa  228  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
487 aa  228  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.43 
 
 
486 aa  228  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
487 aa  228  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
487 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
487 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
487 aa  227  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
490 aa  226  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.92 
 
 
471 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  36.28 
 
 
487 aa  227  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
488 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
487 aa  227  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
487 aa  227  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.56 
 
 
486 aa  226  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.25 
 
 
486 aa  226  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  34.03 
 
 
481 aa  225  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
481 aa  225  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.51 
 
 
487 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.09 
 
 
487 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
489 aa  222  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
487 aa  223  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.73 
 
 
495 aa  222  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
486 aa  221  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
485 aa  219  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.57 
 
 
488 aa  220  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.54 
 
 
489 aa  219  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
492 aa  219  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  38.8 
 
 
474 aa  219  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  32.92 
 
 
492 aa  218  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
486 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
492 aa  218  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  34.57 
 
 
491 aa  218  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.26 
 
 
486 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  32.78 
 
 
492 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  34.07 
 
 
452 aa  217  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.71 
 
 
495 aa  217  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.17 
 
 
482 aa  214  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
490 aa  214  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  34.18 
 
 
496 aa  214  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  32.51 
 
 
492 aa  214  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
492 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  33.12 
 
 
492 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  30.08 
 
 
495 aa  213  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.94 
 
 
498 aa  213  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.73 
 
 
485 aa  213  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  32.01 
 
 
492 aa  213  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  32.3 
 
 
492 aa  212  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  32.11 
 
 
492 aa  211  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.29 
 
 
485 aa  211  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  36.55 
 
 
500 aa  210  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 
505 aa  209  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  36.32 
 
 
505 aa  209  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  36.67 
 
 
484 aa  208  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  37.9 
 
 
506 aa  208  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
466 aa  207  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
492 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.79 
 
 
492 aa  207  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  31.63 
 
 
493 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  33.76 
 
 
493 aa  207  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
405 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  29.88 
 
 
495 aa  206  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
489 aa  204  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
492 aa  204  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0685  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.54 
 
 
485 aa  204  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  34.24 
 
 
492 aa  204  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
503 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  32.76 
 
 
485 aa  203  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1635  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 
464 aa  202  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.766709  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  30.69 
 
 
497 aa  202  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0386  Aldehyde Dehydrogenase  37.44 
 
 
500 aa  200  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.9 
 
 
474 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.83 
 
 
492 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>