More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2908 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  82.55 
 
 
487 aa  791    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  82.75 
 
 
487 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.31 
 
 
488 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.72 
 
 
488 aa  781    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  82.14 
 
 
488 aa  777    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.72 
 
 
488 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  985    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.72 
 
 
488 aa  776    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  83.37 
 
 
487 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  83.16 
 
 
487 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  64.39 
 
 
489 aa  631  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.06 
 
 
487 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
487 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
487 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
487 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
486 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  62.32 
 
 
491 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.79 
 
 
492 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.73 
 
 
495 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
486 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
486 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.99 
 
 
489 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.24 
 
 
486 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.59 
 
 
486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.24 
 
 
492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.06 
 
 
492 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
487 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.2 
 
 
489 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
486 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
492 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.76 
 
 
486 aa  599  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
492 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
492 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  61.7 
 
 
492 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.35 
 
 
486 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.41 
 
 
486 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.49 
 
 
492 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.32 
 
 
492 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.49 
 
 
492 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.84 
 
 
500 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
492 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.84 
 
 
505 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.84 
 
 
505 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
492 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
492 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.28 
 
 
492 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
492 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
487 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.35 
 
 
486 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
498 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  59.47 
 
 
490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.83 
 
 
490 aa  578  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.01 
 
 
495 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
487 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
487 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.41 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.41 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  59.88 
 
 
490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.41 
 
 
485 aa  555  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
489 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.82 
 
 
485 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
485 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
485 aa  521  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.07 
 
 
495 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.55 
 
 
495 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  64.43 
 
 
405 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.57 
 
 
481 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
482 aa  465  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.75 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
471 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.22 
 
 
484 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4556  Aldehyde Dehydrogenase  36.72 
 
 
1577 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0270353  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.97 
 
 
500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.79 
 
 
496 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1152  Aldehyde Dehydrogenase  30.44 
 
 
506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.999135  normal  0.730796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.04 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  34.96 
 
 
516 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  35.05 
 
 
479 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0807  Aldehyde Dehydrogenase  28.28 
 
 
520 aa  206  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3077  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
521 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.389832  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  31.39 
 
 
509 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
493 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.41 
 
 
491 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
498 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  34.13 
 
 
483 aa  203  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2331  Aldehyde Dehydrogenase  29.49 
 
 
581 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222051  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.35 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3732  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
485 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253461  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  32.48 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>