More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1896 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.56 
 
 		 492 aa  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  83.16 
 
 		 492 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 492 aa  999    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  84.19 
 
 		 492 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.56 
 
 		 492 aa  974    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.15 
 
 		 492 aa  970    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  83.98 
 
 		 492 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  79.67 
 
 		 495 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  83.98 
 
 		 492 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.36 
 
 		 492 aa  971    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.76 
 
 		 492 aa  976    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.36 
 
 		 492 aa  973    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  83.57 
 
 		 492 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.76 
 
 		 492 aa  978    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  68.04 
 
 		 490 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  97.56 
 
 		 492 aa  975    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  69.15 
 
 		 489 aa  685    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.08 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.08 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  64.46 
 
 		 500 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  59.59 
 
 		 491 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 492 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.11 
 
 		 487 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.64 
 
 		 486 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.23 
 
 		 486 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.88 
 
 		 486 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.79 
 
 		 486 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.41 
 
 		 486 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 487 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 487 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.64 
 
 		 486 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.82 
 
 		 486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.82 
 
 		 486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 487 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.64 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 		 489 aa  579  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 		 486 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.47 
 
 		 488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.82 
 
 		 486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.73 
 
 		 488 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.82 
 
 		 486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.29 
 
 		 485 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.91 
 
 		 488 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 		 487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.41 
 
 		 487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 		 488 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 		 487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.06 
 
 		 487 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.79 
 
 		 487 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.2 
 
 		 489 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 		 487 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.64 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.64 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 487 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 487 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 487 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.44 
 
 		 487 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 		 489 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.55 
 
 		 495 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  56.58 
 
 		 490 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.35 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.76 
 
 		 487 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.58 
 
 		 487 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.85 
 
 		 485 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  54.04 
 
 		 490 aa  518  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.69 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.27 
 
 		 405 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.54 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 484 aa  432  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.02 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1152  Aldehyde Dehydrogenase  32.1 
 
 		 506 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.999135  normal  0.730796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0807  Aldehyde Dehydrogenase  30.77 
 
 		 520 aa  231  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0870  Aldehyde Dehydrogenase  33.93 
 
 		 528 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0498  Aldehyde Dehydrogenase  31.68 
 
 		 511 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  34.86 
 
 		 516 aa  226  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.98 
 
 		 493 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4055  Aldehyde Dehydrogenase  31.39 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2331  Aldehyde Dehydrogenase  31.39 
 
 		 581 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  32.44 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  32.62 
 
 		 481 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.07 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1200  Aldehyde Dehydrogenase  31.05 
 
 		 527 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  31.55 
 
 		 509 aa  216  8e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  32.63 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  32.78 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.56 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.61 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.61 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>