More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4617 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.93 
 
 
487 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.29 
 
 
488 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
488 aa  980    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  79.67 
 
 
488 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.52 
 
 
487 aa  773    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  79.67 
 
 
488 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.72 
 
 
487 aa  774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.11 
 
 
487 aa  778    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.13 
 
 
488 aa  908    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  82.14 
 
 
487 aa  775    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  64.18 
 
 
489 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.06 
 
 
492 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
487 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.47 
 
 
492 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
487 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
487 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 
492 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.27 
 
 
492 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
487 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.27 
 
 
492 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.06 
 
 
492 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
486 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
486 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
486 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.06 
 
 
492 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  62.94 
 
 
491 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
486 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  62.06 
 
 
492 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
486 aa  608  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 
492 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.41 
 
 
486 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 
492 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
492 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
486 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 
486 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.06 
 
 
492 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
492 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.28 
 
 
489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  63.15 
 
 
490 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
486 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  63.14 
 
 
505 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  63.14 
 
 
505 aa  601  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  63.14 
 
 
500 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.27 
 
 
486 aa  595  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
486 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.76 
 
 
492 aa  591  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.22 
 
 
489 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  60 
 
 
490 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.7 
 
 
495 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.93 
 
 
487 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.86 
 
 
498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.47 
 
 
485 aa  578  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  58.02 
 
 
490 aa  567  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.73 
 
 
487 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
487 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.26 
 
 
485 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.85 
 
 
485 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
489 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.32 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.23 
 
 
485 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.32 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.32 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.32 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.32 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.03 
 
 
495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
495 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  62.38 
 
 
405 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.9 
 
 
481 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
482 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
466 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.16 
 
 
484 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
471 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4556  Aldehyde Dehydrogenase  40.92 
 
 
1577 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0270353  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  36.15 
 
 
500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 
516 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38 
 
 
496 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1152  Aldehyde Dehydrogenase  32.77 
 
 
506 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.999135  normal  0.730796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0807  Aldehyde Dehydrogenase  31.56 
 
 
520 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0498  Aldehyde Dehydrogenase  31.62 
 
 
511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2331  Aldehyde Dehydrogenase  32.34 
 
 
581 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222051  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4055  Aldehyde Dehydrogenase  32.62 
 
 
511 aa  210  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
492 aa  210  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 
479 aa  210  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
482 aa  209  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
498 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
476 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  32.75 
 
 
489 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  32.84 
 
 
499 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.95 
 
 
993 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
499 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>