More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0634 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
492 aa  1009    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.23 
 
 
486 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  64.54 
 
 
487 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  67.62 
 
 
495 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.77 
 
 
486 aa  692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.23 
 
 
486 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  64.61 
 
 
486 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.02 
 
 
486 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  68.87 
 
 
489 aa  718    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.02 
 
 
487 aa  685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  66.39 
 
 
486 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  68.6 
 
 
498 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.98 
 
 
486 aa  681    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.98 
 
 
486 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.15 
 
 
486 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.36 
 
 
487 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.84 
 
 
486 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  70.72 
 
 
490 aa  703    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.23 
 
 
487 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.36 
 
 
487 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  65.57 
 
 
486 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  59.92 
 
 
491 aa  616  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.64 
 
 
487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.78 
 
 
487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.06 
 
 
489 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 
492 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
492 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
492 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
492 aa  591  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.09 
 
 
495 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  57.44 
 
 
492 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.35 
 
 
489 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
492 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
492 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
492 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.02 
 
 
492 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.52 
 
 
490 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.68 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.26 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.41 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
487 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.12 
 
 
488 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
487 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.06 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.06 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.26 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.37 
 
 
492 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  59.05 
 
 
490 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.26 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.71 
 
 
488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.79 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
492 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.79 
 
 
487 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.37 
 
 
492 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
492 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
492 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.76 
 
 
488 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.35 
 
 
488 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.88 
 
 
488 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.62 
 
 
505 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.62 
 
 
505 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.42 
 
 
500 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.41 
 
 
485 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 
485 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
485 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 
485 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
489 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.45 
 
 
495 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.24 
 
 
495 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 
405 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.52 
 
 
482 aa  458  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
484 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.6 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.48 
 
 
466 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  47.94 
 
 
471 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1152  Aldehyde Dehydrogenase  33.19 
 
 
506 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.999135  normal  0.730796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0807  Aldehyde Dehydrogenase  31.77 
 
 
520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.95 
 
 
500 aa  230  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4055  Aldehyde Dehydrogenase  32.98 
 
 
511 aa  227  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0498  Aldehyde Dehydrogenase  32.55 
 
 
511 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2331  Aldehyde Dehydrogenase  32.91 
 
 
581 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0870  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
528 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  34.24 
 
 
498 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4556  Aldehyde Dehydrogenase  34.46 
 
 
1577 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0270353  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  33.54 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  34.54 
 
 
516 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.83 
 
 
479 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  34.58 
 
 
496 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  31.03 
 
 
479 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  33.2 
 
 
483 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.98 
 
 
482 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.98 
 
 
482 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  31.47 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>