More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4294 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  97.54 
 
 
487 aa  940    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  84.39 
 
 
487 aa  818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  84.19 
 
 
487 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  990    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.49 
 
 
487 aa  817    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  95.28 
 
 
487 aa  927    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  86.24 
 
 
487 aa  834    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.7 
 
 
489 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  95.07 
 
 
487 aa  919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.11 
 
 
487 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  85.89 
 
 
405 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  84.19 
 
 
487 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  96.3 
 
 
487 aa  935    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  84.39 
 
 
487 aa  818    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  95.48 
 
 
487 aa  927    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  84.39 
 
 
487 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  96.3 
 
 
487 aa  935    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  62.4 
 
 
491 aa  630  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.06 
 
 
492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
489 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.32 
 
 
486 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.49 
 
 
486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.64 
 
 
492 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.97 
 
 
486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.8 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.33 
 
 
498 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
488 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.57 
 
 
488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.68 
 
 
490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
492 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.41 
 
 
487 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.56 
 
 
487 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
492 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
492 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.5 
 
 
495 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.2 
 
 
492 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  56.4 
 
 
492 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  59.5 
 
 
490 aa  571  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.61 
 
 
492 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
487 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.61 
 
 
492 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
492 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
486 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.78 
 
 
488 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.49 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.82 
 
 
492 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 
487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.2 
 
 
492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.31 
 
 
486 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.61 
 
 
492 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.88 
 
 
486 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
495 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.31 
 
 
486 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
488 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
492 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
492 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
485 aa  551  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.55 
 
 
486 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 
486 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  56.94 
 
 
490 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.34 
 
 
486 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.75 
 
 
500 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.85 
 
 
485 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.2 
 
 
485 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.14 
 
 
495 aa  518  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
495 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.77 
 
 
485 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.75 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.42 
 
 
466 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
484 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.22 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0807  Aldehyde Dehydrogenase  31.79 
 
 
520 aa  236  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3072  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  35.96 
 
 
495 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.828491  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  35.1 
 
 
500 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  34.84 
 
 
481 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1152  Aldehyde Dehydrogenase  32.29 
 
 
506 aa  229  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.999135  normal  0.730796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  34.18 
 
 
498 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4556  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 
1577 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0270353  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  32.4 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0498  Aldehyde Dehydrogenase  30.54 
 
 
511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4055  Aldehyde Dehydrogenase  32 
 
 
511 aa  220  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2331  Aldehyde Dehydrogenase  31.94 
 
 
581 aa  220  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  32.42 
 
 
499 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  32.99 
 
 
480 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  33.13 
 
 
477 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 
489 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 
489 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  32.99 
 
 
477 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>