More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3072 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3072  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
495 aa  1024    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.828491  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
489 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
493 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
493 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.22 
 
 
486 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
489 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
489 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.03 
 
 
482 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.03 
 
 
482 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
489 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.82 
 
 
482 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.82 
 
 
482 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
489 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
489 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
489 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.12 
 
 
487 aa  316  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.52 
 
 
509 aa  316  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.94 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
489 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.92 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
482 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
485 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.71 
 
 
480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
503 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
503 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0904  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
486 aa  309  9e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.19 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.19 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.19 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.19 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
479 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.5 
 
 
480 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.5 
 
 
480 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.5 
 
 
480 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.29 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 
483 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
488 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.29 
 
 
491 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.31 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4998  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.97 
 
 
482 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
482 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.86 
 
 
480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.97 
 
 
482 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.97 
 
 
483 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.97 
 
 
482 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
488 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
482 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
482 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
482 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  38 
 
 
484 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.76 
 
 
482 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.82 
 
 
483 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 
483 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.97 
 
 
482 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.35 
 
 
493 aa  301  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.06 
 
 
482 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
480 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
494 aa  299  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  37.26 
 
 
480 aa  298  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
486 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
482 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
490 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
484 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
475 aa  297  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.15 
 
 
483 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.36 
 
 
486 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
490 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
484 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4665  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
494 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.81 
 
 
488 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.06 
 
 
479 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
486 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
499 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
488 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
499 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4969  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
482 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506966  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
488 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
483 aa  294  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.26 
 
 
490 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  37.26 
 
 
479 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
490 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.13 
 
 
484 aa  292  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>