More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0904 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0904  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  977    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1247  Aldehyde Dehydrogenase  45.07 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.644318  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  45.04 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  35.79 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3072  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  40.34 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.828491  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  38.35 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  38.03 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  38.67 
 
 		 516 aa  299  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  37.73 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  36.74 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.28 
 
 		 496 aa  296  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.25 
 
 		 480 aa  295  9e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  37.4 
 
 		 492 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  36.63 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 479 aa  293  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36 
 
 		 480 aa  292  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  37.24 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  37.76 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.58 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.09 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 		 475 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.37 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.37 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  35.37 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.89 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  32.56 
 
 		 465 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  37.35 
 
 		 510 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.37 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.37 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 		 484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.31 
 
 		 486 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.16 
 
 		 482 aa  287  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.16 
 
 		 480 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.49 
 
 		 499 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.16 
 
 		 482 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.35 
 
 		 484 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142006 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  36.98 
 
 		 501 aa  286  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.37 
 
 		 482 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.31 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.56 
 
 		 483 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  35.67 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.1 
 
 		 482 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.1 
 
 		 482 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.29 
 
 		 484 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  35.49 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  35.52 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  35.37 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.16 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 484 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.95 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  34.51 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.88 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  35.77 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.36 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  36.76 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.46 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  35.27 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  34.1 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.74 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.29 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.42 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  37.16 
 
 		 475 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 		 480 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.74 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.77 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 465 aa  280  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.74 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.24 
 
 		 494 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 		 480 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 		 484 aa  279  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  33.05 
 
 		 465 aa  279  9e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.73 
 
 		 483 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  33.95 
 
 		 490 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.9 
 
 		 494 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  35.16 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.94 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  33.05 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.25 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 		 490 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.34 
 
 		 480 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.56 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  36.63 
 
 		 497 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.93 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 		 477 aa  277  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  34.85 
 
 		 457 aa  277  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  35.43 
 
 		 475 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  35.97 
 
 		 480 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.23 
 
 		 493 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.71 
 
 		 497 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  32.98 
 
 		 494 aa  276  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 		 509 aa  276  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.03 
 
 		 483 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  37.19 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  38.09 
 
 		 482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>