More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1108 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 		 475 aa  966    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  79.37 
 
 		 475 aa  809    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  56.5 
 
 		 477 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  51.8 
 
 		 479 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  52.53 
 
 		 475 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  52.89 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  48.72 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  51.11 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  48.35 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  49.58 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  48.95 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  48.63 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  48.73 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  48.84 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  48.95 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  48.95 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  48.95 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  48.95 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  46.48 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  46.84 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  43.58 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  43.25 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  42.62 
 
 		 475 aa  393  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  45.59 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0327  Aldehyde Dehydrogenase  47.02 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  43.17 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  42.07 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5291  Aldehyde Dehydrogenase  45.83 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  42.29 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  42.51 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 476 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 		 476 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  41.45 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  42.4 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.35 
 
 		 496 aa  349  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.54 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0973  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.54 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0247  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4949  aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2083  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 478 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774453  normal  0.0850344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  45.76 
 
 		 481 aa  346  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  43.2 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  43.2 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1959  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.62 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  42.72 
 
 		 477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0638  aldehyde dehydrogenase  42.99 
 
 		 477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00666091  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  42.96 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  42.96 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3675  aldehyde dehydrogenase  42.96 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.622193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3825  aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 480 aa  339  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  0.0683109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1720  Aldehyde Dehydrogenase  44.64 
 
 		 477 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0498  aldehyde dehydrogenase  42.72 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1249  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0227  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3297  putative dehydrogenase  42 
 
 		 478 aa  334  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 465 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0897  aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 		 479 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1360  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 		 482 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  41.01 
 
 		 481 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.25 
 
 		 506 aa  329  6e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0959  aldehyde dehydrogenase  43.57 
 
 		 487 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  36.02 
 
 		 465 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  36.36 
 
 		 482 aa  323  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3628  Aldehyde Dehydrogenase  43.46 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.15 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  37.22 
 
 		 466 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  35.98 
 
 		 475 aa  317  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 		 480 aa  316  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 		 487 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5877  aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 480 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  35.56 
 
 		 468 aa  312  6.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  35.02 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  37.34 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>