More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1774 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  965    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1387  aldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.673912 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0421  aldehyde dehydrogenase  50.86 
 
 
469 aa  445  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.96029  normal  0.0394656 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0249  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.43 
 
 
473 aa  444  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  45.88 
 
 
478 aa  432  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  46.37 
 
 
468 aa  422  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 
477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  38.44 
 
 
464 aa  325  8.000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 
479 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
475 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
465 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 
485 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
485 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.16 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5877  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  37.58 
 
 
477 aa  314  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  36.72 
 
 
465 aa  312  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.53 
 
 
483 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.53 
 
 
483 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.53 
 
 
483 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.53 
 
 
483 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  36.79 
 
 
465 aa  312  9e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.53 
 
 
483 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.53 
 
 
483 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.53 
 
 
483 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  38.75 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.33 
 
 
483 aa  309  8e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.12 
 
 
483 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
487 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  37.26 
 
 
475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1799  Aldehyde Dehydrogenase  38.58 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  37.86 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  39.33 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  37.42 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1097  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
484 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
465 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  37.42 
 
 
474 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  37.42 
 
 
474 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
484 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  37 
 
 
488 aa  302  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  37.42 
 
 
474 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  37.42 
 
 
474 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  37.42 
 
 
474 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
484 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  36.12 
 
 
475 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1869  putative NADP-dependentglyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase  36.58 
 
 
483 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000063201  normal  0.209762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
484 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
480 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  37.19 
 
 
505 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.33 
 
 
493 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
509 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.27 
 
 
486 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
472 aa  300  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
476 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37 
 
 
484 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  37.47 
 
 
474 aa  299  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
484 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.05 
 
 
484 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  36.98 
 
 
474 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
476 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
482 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  37.21 
 
 
475 aa  298  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  36.61 
 
 
481 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
465 aa  297  3e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
490 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  38.74 
 
 
482 aa  297  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
484 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
484 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
484 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
481 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4795  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  36.79 
 
 
483 aa  296  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000133689  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.7 
 
 
491 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  37.07 
 
 
469 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  36.49 
 
 
476 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  38.67 
 
 
479 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
474 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
487 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.42 
 
 
485 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
496 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
475 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 
482 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 
492 aa  294  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 
484 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.62 
 
 
482 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.11 
 
 
488 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
479 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 
476 aa  293  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
484 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3072  aldehyde dehydrogenase  35.88 
 
 
483 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000976863  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5295  aldehyde dehydrogenase  35.88 
 
 
484 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000061233  decreased coverage  0.00659366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.99 
 
 
485 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
492 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  41.71 
 
 
464 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
490 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>