More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1784 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  62.81 
 
 
491 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.49 
 
 
487 aa  784    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.49 
 
 
487 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.93 
 
 
487 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.49 
 
 
487 aa  784    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  87.68 
 
 
487 aa  889    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.29 
 
 
487 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.52 
 
 
487 aa  804    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.93 
 
 
487 aa  809    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.11 
 
 
487 aa  800    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.11 
 
 
487 aa  792    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  87.47 
 
 
489 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  80.29 
 
 
487 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.52 
 
 
487 aa  804    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  83.42 
 
 
405 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.93 
 
 
487 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  993    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  81.31 
 
 
487 aa  804    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
489 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3767  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157209  normal  0.0254009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1626  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.5 
 
 
495 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1056  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
498 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1835  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
488 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0649  aldehyde dehydrogenase  57.85 
 
 
490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0117173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.34 
 
 
486 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.52 
 
 
486 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0486  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 
489 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
487 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
487 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4478  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
487 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.974998  normal  0.256307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.21 
 
 
486 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.93 
 
 
488 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4282  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.16 
 
 
488 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
486 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.94 
 
 
487 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1437  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
487 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2908  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395764  normal  0.550645 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1896  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.76 
 
 
492 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.93 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3983  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  60.62 
 
 
487 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52670  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1829  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 
492 aa  559  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.11 
 
 
486 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.11 
 
 
486 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 
487 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01715  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 
492 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2842  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
490 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1993  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.14 
 
 
492 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01703  hypothetical protein  55.35 
 
 
492 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1968  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 
492 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.13 
 
 
486 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.55 
 
 
486 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1886  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.14 
 
 
492 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3297  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.13 
 
 
486 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4617  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  58.73 
 
 
488 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
490 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2464  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
492 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.844706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  56.34 
 
 
486 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2193  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
485 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1445  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.73 
 
 
492 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1868  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.1 
 
 
492 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1698  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.31 
 
 
495 aa  544  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.72 
 
 
492 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2041  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
492 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1432  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
492 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1400  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
492 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2119  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
500 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2518  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.75 
 
 
505 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.661362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2227  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.75 
 
 
505 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1666  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
495 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002277  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
485 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00077  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1672  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  48.65 
 
 
495 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2805  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  55.17 
 
 
489 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.731422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2735  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.9 
 
 
485 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1856  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  54.39 
 
 
482 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0556937  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0773  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2203  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
484 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.87702  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0529  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
466 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0939  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
471 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0807  Aldehyde Dehydrogenase  32.84 
 
 
520 aa  256  5e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1152  Aldehyde Dehydrogenase  32.34 
 
 
506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.999135  normal  0.730796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  35.73 
 
 
500 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4055  Aldehyde Dehydrogenase  32.84 
 
 
511 aa  239  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2331  Aldehyde Dehydrogenase  32.22 
 
 
581 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
498 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0498  Aldehyde Dehydrogenase  31.47 
 
 
511 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3072  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  35.27 
 
 
495 aa  237  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.828491  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
479 aa  237  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  33.55 
 
 
509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  36.16 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  35.61 
 
 
477 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
498 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  36.15 
 
 
516 aa  226  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.52 
 
 
480 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.05 
 
 
496 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>