More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2922 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2922  SNF2-related protein  100 
 
 		 660 aa  1348    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.64681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1021  SNF2 family helicase  31.48 
 
 		 631 aa  251  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1461  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.89 
 
 		 630 aa  239  9e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3841  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.092028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  25.81 
 
 		 493 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  25.99 
 
 		 964 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  24.42 
 
 		 898 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  24.56 
 
 		 1112 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  23.71 
 
 		 1386 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  23.37 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  22.58 
 
 		 1357 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  23.27 
 
 		 1362 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  23.88 
 
 		 918 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  22.57 
 
 		 1072 aa  77.4  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  22 
 
 		 1161 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.62 
 
 		 1102 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.74 
 
 		 1067 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  23.63 
 
 		 1414 aa  76.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  22.74 
 
 		 1090 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  21.5 
 
 		 821 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  22.18 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  21.68 
 
 		 1517 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  23.2 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  23.2 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  23.2 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  23.2 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  23.2 
 
 		 918 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  23.2 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  23.2 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  24.75 
 
 		 977 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  22.22 
 
 		 1093 aa  74.3  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  25.25 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  23 
 
 		 918 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.15 
 
 		 1068 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  23 
 
 		 918 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  24.78 
 
 		 1181 aa  72.4  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  23.72 
 
 		 985 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  22.12 
 
 		 1071 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 		 1403 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  22.29 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  23.04 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.7 
 
 		 1082 aa  71.2  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.88 
 
 		 1089 aa  70.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.99 
 
 		 1069 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  22.22 
 
 		 1178 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 		 1129 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  23.37 
 
 		 1077 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1558 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  23.69 
 
 		 1065 aa  69.7  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  21.66 
 
 		 1068 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  23.6 
 
 		 902 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  24.74 
 
 		 1003 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  23.28 
 
 		 901 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  22.75 
 
 		 1110 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  23.79 
 
 		 1130 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  22.56 
 
 		 1531 aa  67.8  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  24.38 
 
 		 959 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  23.21 
 
 		 1068 aa  67.4  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  23.27 
 
 		 1248 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  21.41 
 
 		 995 aa  67.4  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.84 
 
 		 1261 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  22.31 
 
 		 1063 aa  67  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  25.2 
 
 		 891 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  22.34 
 
 		 1048 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  22.4 
 
 		 1108 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.92 
 
 		 1091 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 922 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.96 
 
 		 1112 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  22.41 
 
 		 1443 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  22.08 
 
 		 1026 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  24.65 
 
 		 1107 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  22.43 
 
 		 1394 aa  65.1  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.26 
 
 		 907 aa  65.1  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  21.21 
 
 		 1284 aa  65.1  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  22.4 
 
 		 1437 aa  65.1  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  23.39 
 
 		 970 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  22.56 
 
 		 1013 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  22.61 
 
 		 892 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  22.15 
 
 		 1381 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  23.68 
 
 		 1075 aa  64.7  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  22.65 
 
 		 980 aa  64.7  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  25.81 
 
 		 1127 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 982 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  21.54 
 
 		 1016 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  22.36 
 
 		 1084 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.92 
 
 		 1091 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  23.06 
 
 		 848 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  21.82 
 
 		 917 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.78 
 
 		 1112 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  22.75 
 
 		 1152 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1128 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.44 
 
 		 1118 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  20.79 
 
 		 1259 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  21.28 
 
 		 1566 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  22.25 
 
 		 1100 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  21.98 
 
 		 1031 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  24.5 
 
 		 1010 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  22.42 
 
 		 1066 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  22.31 
 
 		 1068 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>