More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6563 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6563  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2725  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  44.91 
 
 		 594 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  43.69 
 
 		 590 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  43.24 
 
 		 590 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  44.66 
 
 		 578 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  44.98 
 
 		 575 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  39.61 
 
 		 943 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  42.92 
 
 		 512 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  41.96 
 
 		 909 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  40.44 
 
 		 906 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  40.54 
 
 		 593 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 		 541 aa  152  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.09 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  38.53 
 
 		 587 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.84 
 
 		 913 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  41.63 
 
 		 578 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  39.47 
 
 		 906 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  38.36 
 
 		 580 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  37.9 
 
 		 580 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  39.73 
 
 		 580 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  37.33 
 
 		 651 aa  149  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  38.1 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.71 
 
 		 906 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  44.93 
 
 		 579 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  33.33 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 585 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  40.57 
 
 		 925 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.81 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40.45 
 
 		 593 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 1171 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 583 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  37.5 
 
 		 588 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  33.78 
 
 		 312 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  40.28 
 
 		 576 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.02 
 
 		 916 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  42.65 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  40.59 
 
 		 904 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.64 
 
 		 916 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  36.16 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  35.38 
 
 		 906 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  38.91 
 
 		 942 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  39.64 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  37.12 
 
 		 933 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.86 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 308 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  37.98 
 
 		 930 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  40.08 
 
 		 936 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  41.86 
 
 		 915 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  34.8 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  34.02 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  37.31 
 
 		 935 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  38.81 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  41.56 
 
 		 911 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  41.71 
 
 		 583 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  39.62 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  38.07 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  34.82 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  37.26 
 
 		 929 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  40.78 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  36.13 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.15 
 
 		 667 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  39.63 
 
 		 932 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  39.17 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  36.6 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  41.63 
 
 		 916 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  37.25 
 
 		 926 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43 
 
 		 510 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  38.77 
 
 		 919 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  38.94 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  37.75 
 
 		 930 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  33.49 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  40.99 
 
 		 912 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  41.97 
 
 		 582 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  36.96 
 
 		 328 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 930 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  37.69 
 
 		 921 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 		 580 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  38.61 
 
 		 912 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  37.86 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.05 
 
 		 580 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  40.36 
 
 		 901 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  40.36 
 
 		 901 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  40.58 
 
 		 599 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  39.56 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  38.75 
 
 		 922 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  38.87 
 
 		 928 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  39.65 
 
 		 912 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  36.17 
 
 		 326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  38.52 
 
 		 914 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  32.72 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  38.29 
 
 		 918 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  36.58 
 
 		 922 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  37.67 
 
 		 323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>