More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2725 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2725  ABC transporter related protein  100 
 
 		 277 aa  540  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6563  ABC transporter related  51.5 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  39.72 
 
 		 943 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  37.33 
 
 		 651 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.67 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  37.55 
 
 		 921 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  40.65 
 
 		 593 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  39.38 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  38.53 
 
 		 912 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.04 
 
 		 512 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  37.97 
 
 		 942 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  39.27 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  32.46 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  38.62 
 
 		 927 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  41.23 
 
 		 575 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 585 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 		 919 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 576 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  39.45 
 
 		 925 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  39.73 
 
 		 901 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  31.86 
 
 		 589 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.91 
 
 		 916 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  40.65 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  38.46 
 
 		 580 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  36.49 
 
 		 318 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  36.95 
 
 		 927 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2724  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 298 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  41.71 
 
 		 921 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.39 
 
 		 916 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  37.55 
 
 		 583 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  33.02 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  38.77 
 
 		 942 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  39.29 
 
 		 994 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  39.82 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  32.24 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  39.09 
 
 		 920 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  34.88 
 
 		 578 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.12 
 
 		 913 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  35.87 
 
 		 932 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  35.88 
 
 		 914 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  34.98 
 
 		 929 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  35.38 
 
 		 924 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.33 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  38.64 
 
 		 936 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  36.36 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 1089 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.89 
 
 		 1079 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.89 
 
 		 1071 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  36.89 
 
 		 1066 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.89 
 
 		 1082 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.89 
 
 		 1071 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  40.67 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  35.89 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  31.48 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 906 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  31.11 
 
 		 583 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  36.04 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  34.83 
 
 		 1017 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  37.5 
 
 		 927 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  40.67 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  38.46 
 
 		 933 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  31.73 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  34.31 
 
 		 913 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.9 
 
 		 915 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  38.18 
 
 		 582 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  35.8 
 
 		 930 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  37.22 
 
 		 936 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  37.22 
 
 		 936 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  33.49 
 
 		 667 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  37.1 
 
 		 911 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  37.1 
 
 		 911 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  36.84 
 
 		 510 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  32.87 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  37.1 
 
 		 911 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 911 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  36.36 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  37.1 
 
 		 911 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  38.69 
 
 		 580 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  37.96 
 
 		 935 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 		 580 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  37.27 
 
 		 911 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  37.79 
 
 		 922 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  36.74 
 
 		 599 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  31.91 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  34.67 
 
 		 913 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  33.94 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  37.1 
 
 		 911 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  37.1 
 
 		 911 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  36.73 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  39.52 
 
 		 930 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  31.58 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  35.14 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>