69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2472 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2472  porin  100 
 
 		 358 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  60.45 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  47.66 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  47.38 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  47.38 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  47.38 
 
 		 355 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  45.33 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  33.24 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2545  porin  31.55 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  32.14 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  30.59 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  30.37 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  30.09 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1259  porin  33.98 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2365  porin  29.22 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  28.88 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0162  outer membrane protein OmpU  26.74 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  27.72 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  24.91 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  24.91 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  23.96 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  25.27 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  27.59 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  23.51 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  27.88 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  22.27 
 
 		 340 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  24.11 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  25.2 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  26.98 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  26.98 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  29.48 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  31.78 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  30.83 
 
 		 316 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  23.08 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  23.08 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  23.99 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  23.08 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  37.63 
 
 		 347 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  25.56 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  23.68 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  25.36 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  22.78 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  33.96 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  23.55 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  23.82 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  31.58 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3613  porin  22.12 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.57 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  33.33 
 
 		 357 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  35.44 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  28.76 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  29.55 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_003296  RS01789  porin protein  25.64 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  28.76 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  30.84 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  24.65 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  24.06 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  25.23 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000136886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  28.57 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  29.23 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  30.3 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  23.12 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  23.36 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  27.39 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  27.87 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  25 
 
 		 365 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  29.84 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  24.93 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  24.93 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>