73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2545 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2545  porin  100 
 
 		 373 aa  766    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  77.69 
 
 		 362 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  75.71 
 
 		 352 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2365  porin  48.63 
 
 		 361 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1259  porin  44.19 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  52.15 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  51.82 
 
 		 348 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  44.92 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  37.98 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  38.35 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  38.35 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  38.07 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  37.54 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  33.33 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  31.55 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.73 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  30.05 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  29.17 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  29.69 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  29.69 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  26.34 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  28.65 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  29.17 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  26.34 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  28.65 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  27.78 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  28.77 
 
 		 436 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  28.5 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  29.93 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  29.93 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  25 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  28.77 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  27.6 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  28.77 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  28.77 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  28.77 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  29.75 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  28.77 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  28.77 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  29.11 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  28.77 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  28.05 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  27.85 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  26.87 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  28.99 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  28.15 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  28.08 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  28.08 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  28.08 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  26.94 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  28.85 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  28.66 
 
 		 365 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  27.03 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  28.05 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  28.05 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  30.3 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  27.94 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  28.95 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  29.61 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  23.76 
 
 		 324 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  27.47 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  28.43 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  28.81 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  28.81 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1343  porin  30.85 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  27.27 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>