33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2365 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2365  porin  100 
 
 		 361 aa  739    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  53.71 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  51.87 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  58.33 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  58 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2545  porin  48.63 
 
 		 373 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  41.14 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1259  porin  39.89 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  34.44 
 
 		 355 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  34.44 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  34.17 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  34.17 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  32.12 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  29.81 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  29.71 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  33.98 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  32.19 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  28.1 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2113  porin  32.98 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  29.05 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1343  porin  24.41 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  26.74 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  27.88 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  23.76 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  31.85 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  28.8 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  26.84 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  23.93 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  31.21 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  23.3 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1929  porin  25.34 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6150  porin  25.34 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  25.34 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>