196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0254 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0254  teichoic acid translocation permease protein  100 
 
 		 270 aa  534  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0263  ABC-2 type transporter, permease protein  99.26 
 
 		 270 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  35.77 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  35.77 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  35.77 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  35.69 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0297  tagG protein, teichoic acid ABC transporter protein, putative  26.49 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14690  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.36 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  hitchhiker  0.00000217507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  27.95 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0661  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0928677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0676  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 570 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  24.63 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  25.18 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  27.07 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  28.34 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 606 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 604 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  26.87 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  24.44 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  23.51 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  24.24 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  19.62 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 633 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  25.37 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.83 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  25.37 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  26.73 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  28.3 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  22.83 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  26.1 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.52 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  23.33 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  25 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  24.33 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  26.54 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  24.82 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  24.32 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  25.37 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0741  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2045  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 283 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  22.14 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  25.18 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  25.18 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 478 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>