86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0067 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0067  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  724    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.618019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0072  PDZ domain-containing protein  39.42 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031079  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1737  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  38.52 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00781988  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0114  hypothetical protein  38.97 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000396595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1815  PDZ domain-containing protein  39.14 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2003  PDZ domain-containing protein  38.94 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1634  PDZ domain-containing protein  38.64 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1935  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.2 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0336  PDZ/DHR/GLGF  25.69 
 
 		 326 aa  89.7  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.699218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  26.44 
 
 		 511 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  23.41 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  22.75 
 
 		 491 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  21.03 
 
 		 527 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  26.57 
 
 		 523 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  26.49 
 
 		 527 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  24.43 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  21.97 
 
 		 459 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  22.33 
 
 		 491 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  22.33 
 
 		 479 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  22.32 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  24.22 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  26.17 
 
 		 528 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  23.91 
 
 		 491 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  21.04 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  26.49 
 
 		 526 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  23.64 
 
 		 509 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  24.08 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  22.22 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  22.19 
 
 		 473 aa  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  24.59 
 
 		 511 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  21.63 
 
 		 462 aa  49.7  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  22.67 
 
 		 502 aa  49.3  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.97 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  22.82 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  26.67 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  21.99 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  19.53 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  20.6 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  28.66 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  25.32 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  25.32 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  25.32 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  25.32 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  21.32 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  21.43 
 
 		 498 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  25.32 
 
 		 455 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  22.19 
 
 		 505 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  19.81 
 
 		 503 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  19.81 
 
 		 504 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  23.51 
 
 		 480 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  21.92 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  20.87 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  20.87 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  20.87 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  21.96 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  20.87 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  20.87 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  20.87 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  20.87 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  20.44 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  20.74 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  20.44 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  22.98 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  24.85 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  22.5 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  21.17 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  22.29 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  20 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  24.36 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  20 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  22.73 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  20.39 
 
 		 495 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  20.56 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  20.92 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  23.46 
 
 		 471 aa  43.5  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  23.84 
 
 		 485 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  23.61 
 
 		 525 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  21.5 
 
 		 493 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  21.5 
 
 		 494 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  20.44 
 
 		 520 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  34.33 
 
 		 383 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  22.62 
 
 		 489 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  21.5 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  23.93 
 
 		 501 aa  43.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  21.5 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  25.16 
 
 		 485 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>