48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1634 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1634  PDZ domain-containing protein  100 
 
 
356 aa  720    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1815  PDZ domain-containing protein  99.72 
 
 
364 aa  718    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2003  PDZ domain-containing protein  98.03 
 
 
356 aa  709    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0114  hypothetical protein  63.43 
 
 
359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000396595  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1737  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  38.69 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00781988  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0072  PDZ domain-containing protein  37.22 
 
 
365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0067  PDZ domain-containing protein  38.64 
 
 
358 aa  205  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.618019  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1935  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.5 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0336  PDZ/DHR/GLGF  24.06 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.699218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  21.28 
 
 
495 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  25.12 
 
 
520 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  26.12 
 
 
491 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  25 
 
 
495 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  29.1 
 
 
527 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  25 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  25 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  28.36 
 
 
527 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  25 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  27.04 
 
 
527 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  25 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  25 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  25 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  25 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  26.8 
 
 
503 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  26.8 
 
 
493 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  20.62 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  26.8 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  22.59 
 
 
476 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  26.71 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  26.8 
 
 
493 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  21.74 
 
 
480 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  26.8 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  28.57 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  26.58 
 
 
502 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  27.07 
 
 
517 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  25.49 
 
 
494 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.51 
 
 
303 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  21.78 
 
 
515 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.71 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  25.49 
 
 
504 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  23.08 
 
 
513 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  36.92 
 
 
383 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  23.08 
 
 
513 aa  43.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  26.03 
 
 
494 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  32.79 
 
 
386 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15101  PDZ domain-containing protein  28.06 
 
 
565 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.185527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  23.75 
 
 
446 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  19.57 
 
 
301 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>