44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2003 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1634  PDZ domain-containing protein  98.03 
 
 		 356 aa  709    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1815  PDZ domain-containing protein  97.75 
 
 		 364 aa  708    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2003  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  720    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0114  hypothetical protein  63.14 
 
 		 359 aa  442  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000396595  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1737  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  38.69 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00781988  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0072  PDZ domain-containing protein  37.22 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0067  PDZ domain-containing protein  38.94 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.618019  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1935  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.02 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0336  PDZ/DHR/GLGF  24.16 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.699218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  21.01 
 
 		 495 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  25.6 
 
 		 520 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  26.35 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  22.08 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  26.35 
 
 		 483 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  26.35 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  26.35 
 
 		 483 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  26.35 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  26.35 
 
 		 483 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  26.35 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  26.35 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  28.1 
 
 		 503 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  27.4 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  27.67 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  27.22 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  26.8 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  29.19 
 
 		 526 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  21.23 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  20.56 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  26.8 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  27.61 
 
 		 527 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  20.56 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  28.36 
 
 		 527 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  24.7 
 
 		 515 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  25 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  21.12 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  26.71 
 
 		 494 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  26.8 
 
 		 493 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  26.8 
 
 		 493 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  26.8 
 
 		 494 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  23.56 
 
 		 513 aa  42.7  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  23.56 
 
 		 513 aa  42.7  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.71 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  26.8 
 
 		 493 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  20.78 
 
 		 441 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>