31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1935 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1935  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 357 aa  733    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1737  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.12 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00781988  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0072  PDZ domain-containing protein  26.72 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0067  PDZ domain-containing protein  26.86 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.618019  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0336  PDZ/DHR/GLGF  24.53 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.699218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1815  PDZ domain-containing protein  22.03 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0114  hypothetical protein  22.69 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000396595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1634  PDZ domain-containing protein  21.98 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2003  PDZ domain-containing protein  21.67 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  24.68 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  27.68 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  27.12 
 
 		 504 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  20.79 
 
 		 509 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  25.9 
 
 		 473 aa  46.6  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  23.08 
 
 		 498 aa  46.6  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  22.12 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  22.99 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  23.81 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  23.22 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  22.16 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  23.33 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  24.55 
 
 		 471 aa  44.3  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  25.83 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  27.03 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  24.88 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  19.75 
 
 		 476 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  24.26 
 
 		 524 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  20.12 
 
 		 476 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  22.75 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  24.69 
 
 		 471 aa  42.7  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  23.94 
 
 		 494 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>