55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0114 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  736    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000396595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1815  PDZ domain-containing protein  62.09 
 
 		 364 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1634  PDZ domain-containing protein  63.43 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2003  PDZ domain-containing protein  63.14 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0072  PDZ domain-containing protein  38.59 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0067  PDZ domain-containing protein  38.97 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.618019  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1737  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  37.89 
 
 		 369 aa  210  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00781988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1935  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.49 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0336  PDZ/DHR/GLGF  23.83 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.699218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  29.03 
 
 		 511 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  24.31 
 
 		 450 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  23.02 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  28.24 
 
 		 485 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  23.04 
 
 		 473 aa  46.6  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  30.51 
 
 		 472 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  26.89 
 
 		 453 aa  46.2  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  36.84 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  22.44 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  36.84 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  36.84 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  28.69 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  27.86 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  22.48 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.12 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  27.87 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  26.28 
 
 		 527 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  27.05 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  21.79 
 
 		 476 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  27.05 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  25.4 
 
 		 449 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  27.05 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  23.58 
 
 		 451 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  24.03 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  24.03 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  26.88 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  24.03 
 
 		 451 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  24.03 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  26.67 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  54.05 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  24.03 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  26.67 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  25.62 
 
 		 481 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.29 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  25.62 
 
 		 481 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  26.67 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  25.62 
 
 		 481 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  26.02 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  26.02 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  20.28 
 
 		 487 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  22.67 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  27.87 
 
 		 456 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  44.44 
 
 		 384 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  26.02 
 
 		 450 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  34.55 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  24.59 
 
 		 450 aa  42.7  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>