47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1737 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1737  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  100 
 
 		 369 aa  748    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00781988  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0072  PDZ domain-containing protein  73.13 
 
 		 365 aa  556  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0067  PDZ domain-containing protein  38.52 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.618019  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1634  PDZ domain-containing protein  38.69 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2003  PDZ domain-containing protein  38.69 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1815  PDZ domain-containing protein  38.69 
 
 		 364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0114  hypothetical protein  37.89 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000396595  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1935  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.12 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0336  PDZ/DHR/GLGF  23.24 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.699218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  27.04 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  26.61 
 
 		 527 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  25.19 
 
 		 528 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  21.25 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  22.8 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  25.81 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  25.81 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  25.81 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  25.81 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  25.81 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  25.81 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  25.81 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  20.97 
 
 		 502 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  25.66 
 
 		 516 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  27.04 
 
 		 476 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  26.55 
 
 		 482 aa  46.2  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  25.41 
 
 		 493 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  25.41 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  25.27 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  28.03 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  29.06 
 
 		 526 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  25.41 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  23.6 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  25.41 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  25.47 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  29.75 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  26.51 
 
 		 500 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  23.77 
 
 		 469 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  24.6 
 
 		 501 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  28.24 
 
 		 527 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  23.34 
 
 		 476 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  23.91 
 
 		 453 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  21.32 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  21.83 
 
 		 514 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  25.79 
 
 		 511 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  24.32 
 
 		 494 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  27.27 
 
 		 1759 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  22.93 
 
 		 509 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>