More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1075 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1840  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  55.73 
 
 
667 aa  651    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286624  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1778  helix-turn-helix, Fis-type  53.36 
 
 
673 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2160  sigma-54 activated regulatory protein  62.48 
 
 
724 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0698  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  63.11 
 
 
637 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3427  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  71.83 
 
 
648 aa  920    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.535868 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0890  sigma-54 dependent transcriptional regulator  63.36 
 
 
646 aa  792    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1819  sigma-54 activated regulatory protein  63.32 
 
 
651 aa  800    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5659  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  90.39 
 
 
663 aa  1205    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2092  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  55.27 
 
 
676 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000637573  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0309  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.22 
 
 
657 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1075  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
687 aa  1387    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.990194  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0800  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  63.48 
 
 
646 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.236546  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5127  putative sigma-54-dependent transcriptional regulator, HTH Fis-type family  54.89 
 
 
654 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.53901  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1691  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  55.57 
 
 
667 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3388  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  62.94 
 
 
637 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3641  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  62.57 
 
 
691 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4922  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  63.09 
 
 
629 aa  768    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4403  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  62.86 
 
 
628 aa  770    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2486  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  54.11 
 
 
672 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.141183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5308  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  62.86 
 
 
634 aa  778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0711362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4979  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  62.94 
 
 
637 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219279  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7189  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  51.37 
 
 
662 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000334896  normal  0.517977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3234  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  51.77 
 
 
699 aa  631  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0436708  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5158  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  51.35 
 
 
680 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.493898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3245  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.9 
 
 
680 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0735  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  48.94 
 
 
683 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.431182  normal  0.0765632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5123  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.9 
 
 
680 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0328449  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6248  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  53.81 
 
 
708 aa  605  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423516  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5897  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.9 
 
 
669 aa  602  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313078 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5969  putative phytochrome sensor protein  53.1 
 
 
663 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118543  normal  0.0102226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6164  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.23 
 
 
666 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0285  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  49.09 
 
 
687 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1790  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  51.76 
 
 
753 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000112297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0479  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  48.22 
 
 
712 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2583  sigma-54 activated regulatory protein  44.92 
 
 
709 aa  535  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3538  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  45.78 
 
 
660 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1556  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  44.05 
 
 
657 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0932  sigma54 specific transcriptional regulator  43.99 
 
 
653 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.702555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1000  helix-turn-helix, Fis-type  44 
 
 
661 aa  492  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1741  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.2 
 
 
609 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.606989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0899  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.68 
 
 
632 aa  492  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599128  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1043  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.68 
 
 
632 aa  492  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.917083  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2813  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.05 
 
 
699 aa  492  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.475478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2870  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.05 
 
 
676 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4569  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.27 
 
 
638 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1963  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.47 
 
 
647 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1744  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.77 
 
 
652 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0785861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2864  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.37 
 
 
651 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414238  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0343  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.49 
 
 
640 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00036469  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5649  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.21 
 
 
653 aa  416  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5954  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.32 
 
 
677 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0983903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2736  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.33 
 
 
662 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.419098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2614  putative transcriptional regulator  41.61 
 
 
682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6490  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.42 
 
 
701 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519588  normal  0.249204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7557  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.4 
 
 
627 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.36 
 
 
611 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4584  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.83 
 
 
692 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3077  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.39 
 
 
682 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1088  transcriptional regulator  39.77 
 
 
640 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3145  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.61 
 
 
705 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3741  sigma-54 dependent transcriptional regulator  37.28 
 
 
617 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3636  sigma54 specific transcriptional regulator  37.72 
 
 
616 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1400  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.56 
 
 
629 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0585  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.77 
 
 
671 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0546  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.9 
 
 
725 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1736  helix-turn-helix, Fis-type  38.25 
 
 
617 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.590224  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4988  sigma54 specific transcriptional regulator  41.22 
 
 
638 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2439  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.14 
 
 
625 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0591  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.29 
 
 
671 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.495015  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0336  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  36.8 
 
 
684 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1734  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  37.01 
 
 
682 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0367  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.15 
 
 
696 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11830  transcriptional regulator  40.06 
 
 
643 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0962439  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3175  putative GAF sensor protein  35.11 
 
 
629 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08020  Sigma54-dependent transcriptional activator  38.42 
 
 
631 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0598  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.16 
 
 
661 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0902  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  35.43 
 
 
672 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2951  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.25 
 
 
639 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0236757  normal  0.346853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2469  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.84 
 
 
636 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2301  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.23 
 
 
636 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0381  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.28 
 
 
663 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.24565  normal  0.15807 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5133  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.95 
 
 
584 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0596409  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3467  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.06 
 
 
636 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1039  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.89 
 
 
666 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3129  transcription regulator protein  37.94 
 
 
637 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.869922  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2338  sigma-54 factor, interaction region  34.28 
 
 
612 aa  350  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00232257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2789  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.77 
 
 
668 aa  350  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0251  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.09 
 
 
628 aa  346  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000347396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2694  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.21 
 
 
637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777971  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3727  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.57 
 
 
653 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0270  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.54 
 
 
598 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3109  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.14 
 
 
666 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3771  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.47 
 
 
619 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02421  hypothetical protein  31.87 
 
 
587 aa  339  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1413  sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.4 
 
 
587 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1975  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.52 
 
 
614 aa  336  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1863  sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.52 
 
 
605 aa  336  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4046  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.98 
 
 
668 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.38 
 
 
661 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1866  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.36 
 
 
639 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102196  hitchhiker  0.00350069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>