249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0728 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0728  putative outer membrane fimbrial usher porin precursor  100 
 
 		 725 aa  1456    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.72 
 
 		 852 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.85 
 
 		 880 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.2 
 
 		 886 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.53 
 
 		 850 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.94 
 
 		 852 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.03 
 
 		 866 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.97 
 
 		 1040 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.86 
 
 		 872 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.97 
 
 		 884 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.98 
 
 		 867 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.59 
 
 		 866 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.64 
 
 		 861 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  35.99 
 
 		 870 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.99 
 
 		 870 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.48 
 
 		 963 aa  363  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.65 
 
 		 856 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  37.16 
 
 		 901 aa  350  8e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.99 
 
 		 901 aa  347  4e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.27 
 
 		 930 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  35.4 
 
 		 842 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  35.73 
 
 		 844 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  36.46 
 
 		 939 aa  328  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  36.68 
 
 		 914 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  36.68 
 
 		 913 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  36.68 
 
 		 914 aa  324  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  33.88 
 
 		 865 aa  306  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.01 
 
 		 880 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.76 
 
 		 836 aa  297  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  31.72 
 
 		 866 aa  296  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.45 
 
 		 851 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  31.67 
 
 		 866 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.9 
 
 		 863 aa  284  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  33.9 
 
 		 854 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.42 
 
 		 865 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  31.9 
 
 		 866 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  31.9 
 
 		 866 aa  283  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  30.57 
 
 		 861 aa  283  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  33.73 
 
 		 854 aa  281  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  31.52 
 
 		 888 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.95 
 
 		 890 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  34.95 
 
 		 833 aa  278  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.58 
 
 		 883 aa  273  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  31.58 
 
 		 883 aa  272  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  32.18 
 
 		 875 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.5 
 
 		 929 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  30.9 
 
 		 866 aa  263  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  35.85 
 
 		 866 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.08 
 
 		 887 aa  260  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  32.11 
 
 		 839 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.85 
 
 		 837 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.35 
 
 		 819 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.4 
 
 		 844 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  31.92 
 
 		 840 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  34.41 
 
 		 839 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.82 
 
 		 871 aa  247  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  31.45 
 
 		 872 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  32.34 
 
 		 868 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.51 
 
 		 876 aa  241  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.81 
 
 		 851 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  31.94 
 
 		 878 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 878 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  31.94 
 
 		 878 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  31.76 
 
 		 878 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  32.3 
 
 		 863 aa  238  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  30.48 
 
 		 856 aa  236  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  29.15 
 
 		 828 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  29.67 
 
 		 866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  29.98 
 
 		 866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  28.98 
 
 		 828 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.74 
 
 		 835 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.81 
 
 		 866 aa  234  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  29.81 
 
 		 866 aa  233  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  29.98 
 
 		 866 aa  233  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  29.81 
 
 		 866 aa  233  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  29.31 
 
 		 828 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  31.83 
 
 		 848 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  31.83 
 
 		 848 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  31.83 
 
 		 848 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  29.8 
 
 		 839 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  31.12 
 
 		 848 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30 
 
 		 851 aa  230  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  30.94 
 
 		 848 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.12 
 
 		 852 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  30.7 
 
 		 866 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  31.12 
 
 		 851 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  31.19 
 
 		 871 aa  228  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.77 
 
 		 877 aa  226  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.04 
 
 		 826 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.04 
 
 		 826 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  29.22 
 
 		 844 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.82 
 
 		 875 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.79 
 
 		 833 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  30.04 
 
 		 826 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.82 
 
 		 875 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  29.15 
 
 		 853 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  29.15 
 
 		 853 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.75 
 
 		 840 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.3 
 
 		 888 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  31.46 
 
 		 740 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>