245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 547 aa  1064    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  59.78 
 
 		 547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  61.32 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  56.97 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  53.97 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  50.85 
 
 		 524 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  52.67 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  51.68 
 
 		 520 aa  485  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  54.79 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  49.22 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  50 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  49.8 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  49.8 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  48.53 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  49.8 
 
 		 508 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  49.45 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  49.8 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  49.8 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  48.33 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  48.29 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  49.18 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  49.39 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  44.21 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  44.85 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  43.82 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  43.74 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  42.35 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  42.51 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  41.87 
 
 		 495 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  42.39 
 
 		 510 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  41.7 
 
 		 486 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  41.93 
 
 		 488 aa  362  9e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  41.41 
 
 		 527 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  39.57 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  41.15 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  40.68 
 
 		 498 aa  346  7e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  41.12 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  39.76 
 
 		 503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  39.44 
 
 		 503 aa  323  7e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  39.44 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  39.64 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  37.38 
 
 		 498 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  37.96 
 
 		 499 aa  277  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  38.04 
 
 		 493 aa  240  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  37.9 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  32.78 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  33.4 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.31 
 
 		 476 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.17 
 
 		 452 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.8 
 
 		 461 aa  177  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.54 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.03 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  33.42 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  33.61 
 
 		 452 aa  170  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  32.2 
 
 		 455 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  32.47 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  32.68 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  29.82 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  29.13 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.16 
 
 		 454 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.89 
 
 		 464 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  30.52 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.38 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  31.25 
 
 		 470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  30.48 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  30.88 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  30.84 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  34.95 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  34.95 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  34.95 
 
 		 454 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  34.95 
 
 		 454 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  30.03 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  32.08 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30 
 
 		 453 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  30.39 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  30.05 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  29.17 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  30.07 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  29.91 
 
 		 448 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  29.7 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  29.12 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  31.59 
 
 		 468 aa  156  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  31.61 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  28.39 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  28.68 
 
 		 438 aa  156  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  31.6 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  34.14 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  28.67 
 
 		 448 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 		 446 aa  153  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  28.66 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  31.68 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  30.72 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  31.56 
 
 		 443 aa  150  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  30.75 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  30.95 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  30 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  31.41 
 
 		 452 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  33.68 
 
 		 448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1166 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>