245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0251 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 524 aa  1031    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  65.07 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  50.85 
 
 		 547 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  51.36 
 
 		 547 aa  498  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  52.4 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  52.04 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  53.86 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  51.93 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  50.59 
 
 		 517 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  50.41 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  49.4 
 
 		 553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  46.96 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  46.76 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  46.76 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  46.56 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  46.76 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  46.76 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  46.56 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  46.36 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  46.15 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  46.34 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  46.54 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  43.92 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  41.88 
 
 		 502 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  44.6 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  42.48 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  41.82 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  41.44 
 
 		 527 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  39.68 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  39.96 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  40.88 
 
 		 498 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  40.37 
 
 		 486 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  40.21 
 
 		 493 aa  356  6.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  39.01 
 
 		 495 aa  350  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  41 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  39.01 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  40.78 
 
 		 503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  39.48 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  40.78 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  39.63 
 
 		 503 aa  340  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  38.06 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  37.31 
 
 		 498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  36.34 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  38.36 
 
 		 493 aa  231  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  35.05 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  32.17 
 
 		 453 aa  192  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.64 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.19 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  31.83 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  29.74 
 
 		 461 aa  181  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  30.87 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.65 
 
 		 454 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  30.9 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  30.84 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  30.69 
 
 		 446 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  30.39 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  30.69 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  30.47 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.56 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  30.47 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  30.17 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  30.47 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  30.56 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  30.6 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  26.75 
 
 		 458 aa  174  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  31.99 
 
 		 518 aa  174  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  34.18 
 
 		 446 aa  173  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  35.15 
 
 		 446 aa  173  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  33.87 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  32.6 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  29.74 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  30.15 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  32.28 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.56 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1908  sodium:neurotransmitter symporter  28.66 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0707768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.71 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  31.17 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.65 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  27.18 
 
 		 454 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.24 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.56 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.65 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.09 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  32.98 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.32 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  30.98 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.17 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.92 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  32.45 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.34 
 
 		 443 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  29.96 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  29.09 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  32.43 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  28.69 
 
 		 453 aa  160  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  29.69 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  31.57 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>