245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1714 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  100 
 
 		 502 aa  998    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  57.98 
 
 		 547 aa  542  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  56.97 
 
 		 547 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  57.11 
 
 		 525 aa  518  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  52.24 
 
 		 524 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  52.58 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  51.73 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  49.69 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  49.69 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  49.69 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  49.69 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  49.69 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  49.29 
 
 		 508 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  49.49 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  48.68 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  49.49 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  49.08 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  49.29 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  52.11 
 
 		 517 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  48.24 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  48.89 
 
 		 520 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  46.22 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  45.63 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  45.6 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  44.76 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  42.21 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  43.76 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  40.58 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  41.18 
 
 		 527 aa  364  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  42.11 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  40.12 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  39.96 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  40.99 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  40.52 
 
 		 498 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  38.79 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  40.66 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  39.68 
 
 		 498 aa  336  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  38.78 
 
 		 503 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  38.73 
 
 		 503 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  38.37 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  36.53 
 
 		 494 aa  296  6e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  36.69 
 
 		 498 aa  294  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  35.45 
 
 		 499 aa  257  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  39.24 
 
 		 493 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  36.41 
 
 		 431 aa  200  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.47 
 
 		 453 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.83 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.07 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  35.95 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.78 
 
 		 455 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.15 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  35.66 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  34.38 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  31.46 
 
 		 483 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.7 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.22 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.71 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  34.16 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  33.7 
 
 		 464 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  31.82 
 
 		 437 aa  176  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  32.69 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.52 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.05 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.61 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  37.38 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  33.43 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  32.18 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.04 
 
 		 446 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 446 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 446 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  32.4 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.16 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  31.72 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.05 
 
 		 443 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 446 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  31.01 
 
 		 446 aa  173  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.35 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.61 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  31.54 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  31.51 
 
 		 446 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  32.4 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.15 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  32.4 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  30.91 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.95 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  32.32 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.72 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  33.07 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  31.49 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  34.03 
 
 		 454 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 		 518 aa  169  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  33.71 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.64 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  31.25 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  30.77 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.24 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  36.19 
 
 		 470 aa  167  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>