245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2909 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  63.35 
 
 
508 aa  664    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  62.15 
 
 
508 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  63.15 
 
 
508 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  63.35 
 
 
508 aa  664    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  63.35 
 
 
508 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  62.55 
 
 
508 aa  654    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
506 aa  1004    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  63.35 
 
 
508 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  63.15 
 
 
508 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  62.35 
 
 
508 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  63.15 
 
 
508 aa  661    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  63.35 
 
 
508 aa  663    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  55.86 
 
 
514 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  56.15 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  54.34 
 
 
492 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  49.9 
 
 
502 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  53.81 
 
 
517 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  48.9 
 
 
502 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  49.9 
 
 
488 aa  478  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  49.22 
 
 
547 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  48.79 
 
 
527 aa  475  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  49.28 
 
 
488 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  48.46 
 
 
499 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  48.86 
 
 
486 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  50.41 
 
 
524 aa  461  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  47.41 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  49.07 
 
 
497 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  48.77 
 
 
525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  49.59 
 
 
520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  48.84 
 
 
498 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  46.34 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  45.17 
 
 
493 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  44.22 
 
 
510 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  47.46 
 
 
498 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  46.41 
 
 
502 aa  435  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  44.9 
 
 
503 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  47.49 
 
 
553 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  43.82 
 
 
503 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  43.61 
 
 
503 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  42.98 
 
 
503 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  41.14 
 
 
494 aa  376  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  41.77 
 
 
498 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  37.27 
 
 
499 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  36.6 
 
 
493 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.02 
 
 
453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 
464 aa  206  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.62 
 
 
470 aa  203  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.48 
 
 
449 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.65 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  31.44 
 
 
518 aa  196  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  31.22 
 
 
476 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 
446 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.05 
 
 
446 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.95 
 
 
446 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 
475 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  33.81 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.52 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  33.57 
 
 
446 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  33.57 
 
 
446 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  33.57 
 
 
446 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.25 
 
 
446 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.89 
 
 
446 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  32.17 
 
 
459 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.98 
 
 
453 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.25 
 
 
446 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  30.99 
 
 
488 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  31.52 
 
 
443 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.1 
 
 
446 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.3 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.56 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.01 
 
 
468 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  33.24 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.02 
 
 
431 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  30.33 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  32.7 
 
 
458 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  31.19 
 
 
456 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  30.57 
 
 
454 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  28.81 
 
 
469 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  29.81 
 
 
452 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  30.91 
 
 
448 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  31.96 
 
 
484 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  32.42 
 
 
446 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  28.12 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08966  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 
675 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.95 
 
 
450 aa  173  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  28.08 
 
 
461 aa  174  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  32.09 
 
 
483 aa  173  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  31.02 
 
 
461 aa  173  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  31.87 
 
 
450 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  32.63 
 
 
452 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  32.64 
 
 
473 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.56 
 
 
486 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  30.09 
 
 
454 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 
455 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  30.09 
 
 
457 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.51 
 
 
445 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.51 
 
 
445 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  33.7 
 
 
445 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  33.7 
 
 
445 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  31.46 
 
 
452 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>